39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1529 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1529  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 499 aa  1005    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417351  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1690  lipopolysaccharide biosynthesis  28.05 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000356415  normal  0.0111371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  22.31 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  23.58 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1960  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 		 704 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38724  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3715  lipopolysaccharide biosynthesis  21.9 
 
 		 712 aa  90.9  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.49 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.04 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  23.58 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3304  lipopolysaccharide biosynthesis  21.61 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  20.33 
 
 		 806 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  23.02 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  24.37 
 
 		 790 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 664 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2020  lipopolysaccharide biosynthesis  21.5 
 
 		 530 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.57 
 
 		 734 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  20.59 
 
 		 772 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3118  lipopolysaccharide biosynthesis  21.69 
 
 		 532 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0491036  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  23.46 
 
 		 518 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2335  lipopolysaccharide biosynthesis  22.18 
 
 		 505 aa  53.5  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 804 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0585  lipopolysaccharide biosynthesis  23.5 
 
 		 537 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  22.36 
 
 		 662 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  22.36 
 
 		 662 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3532  exopolysaccharide biosythesis protein PslE  19.27 
 
 		 663 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.393187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4032  PEP-CTERM locus polysaccharide chain length determinant  23.47 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077437  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.28 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  22.38 
 
 		 741 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  22.94 
 
 		 505 aa  47  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  24.52 
 
 		 739 aa  47  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 737 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1507  lipopolysaccharide biosynthesis  20.46 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.577803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  23.41 
 
 		 759 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  22.7 
 
 		 738 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.93 
 
 		 653 aa  44.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2661  lipopolysaccharide biosynthesis  22.93 
 
 		 773 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5844  protein-tyrosine kinase  21.61 
 
 		 780 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  20.8 
 
 		 518 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>