21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1690 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1690  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 512 aa  992    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000356415  normal  0.0111371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1529  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.05 
 
 		 499 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417351  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 		 664 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  22.47 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  26.14 
 
 		 764 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  20.85 
 
 		 734 aa  53.5  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 653 aa  53.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3304  lipopolysaccharide biosynthesis  23.76 
 
 		 663 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417507  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  21.26 
 
 		 487 aa  50.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1960  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 704 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38724  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 701 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3532  exopolysaccharide biosythesis protein PslE  23.1 
 
 		 663 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.393187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  25.41 
 
 		 662 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  23.27 
 
 		 742 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  29.87 
 
 		 505 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.61 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  27.27 
 
 		 508 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5484  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.95785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  25.08 
 
 		 662 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  22.93 
 
 		 722 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.07 
 
 		 747 aa  43.5  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>