More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3108 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3108  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1020 aa  2066    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.2566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  36.5 
 
 		 969 aa  599  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3144  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 1040 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  32.36 
 
 		 961 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 935 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2993  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 966 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000340556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 948 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1368  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 958 aa  350  6e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000266767  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1437  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 958 aa  350  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.15469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  31.42 
 
 		 929 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 976 aa  333  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 976 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 914 aa  304  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 966 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 965 aa  300  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 924 aa  291  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 969 aa  291  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1589  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 998 aa  289  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.36828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 901 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 907 aa  288  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3766  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 920 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 907 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 897 aa  283  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 981 aa  283  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 935 aa  278  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 951 aa  274  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1007 aa  271  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 1007 aa  268  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 966 aa  267  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 869 aa  266  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 1007 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 912 aa  265  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 957 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  27.52 
 
 		 1007 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  27.85 
 
 		 966 aa  260  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 904 aa  260  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 967 aa  256  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 937 aa  255  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  29.56 
 
 		 936 aa  254  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 1028 aa  254  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 904 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 951 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 904 aa  250  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 904 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 938 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 953 aa  248  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 947 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 946 aa  248  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1015 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 933 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 930 aa  244  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 930 aa  244  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 930 aa  244  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 1009 aa  243  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 944 aa  241  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 935 aa  240  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 935 aa  240  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 935 aa  240  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 922 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 842 aa  238  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1513  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 964 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 873 aa  234  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2073  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 1000 aa  233  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168139  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 873 aa  230  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 1088 aa  228  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 939 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.52 
 
 		 839 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0591  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 1032 aa  222  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 910 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 940 aa  218  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 853 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 853 aa  218  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.02 
 
 		 855 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 974 aa  217  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 836 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  26.04 
 
 		 853 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 853 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 853 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 855 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 843 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 841 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 975 aa  211  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 952 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 944 aa  208  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.52 
 
 		 914 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 985 aa  201  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 987 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2400  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 1004 aa  199  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.204664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 838 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 817 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 981 aa  196  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  27.71 
 
 		 709 aa  191  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02110  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 824 aa  189  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 869 aa  178  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.63 
 
 		 877 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 904 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3783  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 987 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00272324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 973 aa  174  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 944 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 901 aa  171  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>