More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0104 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  296  7e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  62.07 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  58.17 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  48.32 
 
 		 300 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  44.59 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  51.01 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  46.94 
 
 		 297 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  44.67 
 
 		 317 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  40 
 
 		 296 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  43.45 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  40 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.76 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  37.86 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1819  hypothetical protein  48.63 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  37.32 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  36 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.8 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2716  hypothetical protein  40.49 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  43.24 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  35.17 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  32.17 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  39.16 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  35.37 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  37.14 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  38.46 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  33.1 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.19 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  32.65 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.92 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  34.27 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  31.69 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  34.69 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  34.69 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  35.9 
 
 		 314 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  37.84 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.89 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  38.26 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  38.26 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  38.26 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  38.26 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  38.26 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  38.26 
 
 		 164 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  36.99 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.03 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  32.87 
 
 		 150 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  35.86 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  34.93 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  34.93 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  34.93 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  35.37 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.33 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  38.46 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.36 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  32.24 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  35.66 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  32.88 
 
 		 288 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.99 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  35.86 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  31.76 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  34.72 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  34.69 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  34.87 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  34.72 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  34.87 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.94 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  33.12 
 
 		 160 aa  67  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  35.62 
 
 		 289 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  39.01 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 145 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.23 
 
 		 320 aa  67  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  33.55 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  35.81 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>