More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1819 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1819  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  350  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  50.35 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  45.45 
 
 		 300 aa  97.1  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  51.35 
 
 		 152 aa  88.2  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  41.55 
 
 		 303 aa  85.5  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  47.3 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  39.16 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  38.73 
 
 		 143 aa  72  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  37.42 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  36.49 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  37.82 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.92 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  32 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.88 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  40.85 
 
 		 317 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  38.3 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  28.08 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.03 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  37.25 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  33.55 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  34.93 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  33.33 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  44.14 
 
 		 297 aa  64.7  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.9 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  32 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.45 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  35.81 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  32 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  38.75 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  32.62 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.88 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  32.62 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  32 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  32 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  32 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  32 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  32 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  31.25 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  34.03 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  41.38 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  33.1 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  33.57 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  33.99 
 
 		 151 aa  62  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  31.21 
 
 		 153 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  39.58 
 
 		 161 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.62 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  37.75 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.79 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.19 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  35.1 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  33.33 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  34.72 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.07 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.08 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  32 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  31.54 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  35.16 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  34.75 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  47.83 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  38.06 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  38.06 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  38.06 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  38.1 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.99 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>