More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0835 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  81.03 
 
 		 196 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  80 
 
 		 206 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  67.69 
 
 		 209 aa  266  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 209 aa  248  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 193 aa  246  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  62.81 
 
 		 194 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  48.73 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 196 aa  154  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 223 aa  98.2  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  32.54 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  34.86 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  31.09 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  30.63 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 225 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  26.06 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  30.62 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4794  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.21 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>