280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1941 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  55.24 
 
 		 891 aa  953    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  61.08 
 
 		 919 aa  1110    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  100 
 
 		 903 aa  1827    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  65.4 
 
 		 604 aa  825    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  47.62 
 
 		 873 aa  782    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.96 
 
 		 986 aa  687    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  62.34 
 
 		 922 aa  1139    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.45 
 
 		 805 aa  599  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  39.22 
 
 		 827 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.62 
 
 		 813 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  39.24 
 
 		 1015 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  40.59 
 
 		 928 aa  548  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.45 
 
 		 824 aa  534  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  37.56 
 
 		 806 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  38.38 
 
 		 832 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  33.96 
 
 		 1355 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  33.3 
 
 		 961 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  36.65 
 
 		 932 aa  433  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.46 
 
 		 794 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  31.92 
 
 		 984 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.44 
 
 		 1781 aa  415  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.02 
 
 		 811 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  33.29 
 
 		 925 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  32.5 
 
 		 1185 aa  404  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.72 
 
 		 787 aa  391  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  33.49 
 
 		 825 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  34.89 
 
 		 964 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  32.73 
 
 		 799 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.18 
 
 		 805 aa  379  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  30.38 
 
 		 806 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 807 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.51 
 
 		 808 aa  353  8e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  32.66 
 
 		 829 aa  345  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 		 858 aa  343  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.86 
 
 		 1093 aa  327  7e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  30.6 
 
 		 859 aa  317  9e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2936  beta-galactosidase  58.96 
 
 		 309 aa  307  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.41 
 
 		 882 aa  293  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  34.77 
 
 		 815 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  33.84 
 
 		 655 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.62 
 
 		 837 aa  241  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  27.09 
 
 		 862 aa  234  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.54 
 
 		 897 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.57 
 
 		 750 aa  219  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  24.28 
 
 		 743 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  32.34 
 
 		 888 aa  182  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  25.48 
 
 		 707 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 		 803 aa  172  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.7 
 
 		 858 aa  170  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  25.29 
 
 		 848 aa  161  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  25.29 
 
 		 824 aa  157  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  25.55 
 
 		 704 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  25.61 
 
 		 979 aa  154  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 781 aa  154  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.64 
 
 		 781 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  26.07 
 
 		 894 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  30.89 
 
 		 785 aa  149  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  38.12 
 
 		 233 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.82 
 
 		 747 aa  147  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  24.87 
 
 		 754 aa  146  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.96 
 
 		 748 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.71 
 
 		 717 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  29.21 
 
 		 763 aa  141  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 766 aa  138  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  25.94 
 
 		 577 aa  138  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.05 
 
 		 1033 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  24.54 
 
 		 804 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  25.43 
 
 		 1044 aa  133  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  24.61 
 
 		 1455 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  27.06 
 
 		 1129 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 951 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  28.94 
 
 		 1043 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  28.11 
 
 		 512 aa  129  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.95 
 
 		 913 aa  128  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.73 
 
 		 1171 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 		 1077 aa  127  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  27.63 
 
 		 1020 aa  127  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 		 1049 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.7 
 
 		 644 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  25.75 
 
 		 677 aa  126  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.41 
 
 		 1289 aa  125  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  25.79 
 
 		 1017 aa  125  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.1 
 
 		 1036 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  26.01 
 
 		 1175 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.2 
 
 		 1264 aa  125  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  26.09 
 
 		 1076 aa  125  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.32 
 
 		 741 aa  124  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  26.83 
 
 		 670 aa  124  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 		 1079 aa  124  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.33 
 
 		 972 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  23.94 
 
 		 804 aa  124  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  26.82 
 
 		 596 aa  124  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  27.78 
 
 		 1084 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  27.58 
 
 		 603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  28.57 
 
 		 598 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  29.37 
 
 		 1063 aa  122  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  24.51 
 
 		 1108 aa  121  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  27.1 
 
 		 603 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  27.72 
 
 		 1084 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  27.1 
 
 		 603 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>