148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1979 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 947 aa  1899    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  32.85 
 
 		 1040 aa  345  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  32.75 
 
 		 1748 aa  265  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  32.89 
 
 		 1753 aa  265  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  33 
 
 		 1770 aa  262  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  32.91 
 
 		 1762 aa  261  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  32.91 
 
 		 1762 aa  261  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  32.75 
 
 		 1763 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  32.75 
 
 		 1770 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  32.64 
 
 		 1099 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  35.01 
 
 		 1093 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  35.01 
 
 		 1093 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  28.95 
 
 		 1067 aa  234  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  28.98 
 
 		 1070 aa  228  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  28.73 
 
 		 1070 aa  225  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  32.72 
 
 		 909 aa  224  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  34.29 
 
 		 1115 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  29.49 
 
 		 1234 aa  212  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  34.25 
 
 		 818 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.43 
 
 		 1023 aa  203  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  34.56 
 
 		 819 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  34.15 
 
 		 825 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  33.4 
 
 		 924 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  28.26 
 
 		 1008 aa  182  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  30.22 
 
 		 995 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  34.47 
 
 		 1049 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  26.71 
 
 		 1594 aa  166  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  27.14 
 
 		 1579 aa  158  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.05 
 
 		 950 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.21 
 
 		 3420 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  30.55 
 
 		 3415 aa  151  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  31.59 
 
 		 1741 aa  149  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  30.69 
 
 		 1277 aa  147  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  31.12 
 
 		 1108 aa  146  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  31.59 
 
 		 914 aa  144  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  28.48 
 
 		 949 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  29.12 
 
 		 948 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  29.06 
 
 		 948 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  27.76 
 
 		 1806 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.9 
 
 		 1009 aa  141  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.72 
 
 		 1039 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  28.69 
 
 		 948 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  31.6 
 
 		 1571 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  24.85 
 
 		 773 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  28.07 
 
 		 864 aa  137  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.49 
 
 		 1357 aa  135  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.64 
 
 		 2906 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  32.3 
 
 		 2578 aa  135  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  31.51 
 
 		 1012 aa  135  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  32.3 
 
 		 1861 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  29.35 
 
 		 1349 aa  132  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  29.35 
 
 		 1327 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  29.35 
 
 		 1327 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 1028 aa  129  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.15 
 
 		 1055 aa  129  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  27.95 
 
 		 773 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  29.91 
 
 		 989 aa  126  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.25 
 
 		 1327 aa  126  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  27.72 
 
 		 1593 aa  124  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  28.86 
 
 		 927 aa  121  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  26.61 
 
 		 732 aa  121  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.31 
 
 		 729 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  28.25 
 
 		 466 aa  119  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.24 
 
 		 868 aa  119  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  27.66 
 
 		 1113 aa  118  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  25.47 
 
 		 709 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.03 
 
 		 769 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  28.45 
 
 		 1259 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  28.42 
 
 		 4312 aa  115  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  29.88 
 
 		 2926 aa  114  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.7 
 
 		 4391 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  27.07 
 
 		 730 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  28.25 
 
 		 1285 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 		 1268 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  28.88 
 
 		 1254 aa  111  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1165 aa  111  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1165 aa  111  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  29.06 
 
 		 1259 aa  111  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.15 
 
 		 1086 aa  111  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  28.64 
 
 		 1269 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  24.34 
 
 		 1102 aa  107  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  30.26 
 
 		 1626 aa  106  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  26.49 
 
 		 1068 aa  105  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  26.29 
 
 		 2637 aa  103  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  26.46 
 
 		 733 aa  101  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  27.7 
 
 		 506 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  27.61 
 
 		 2057 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26 
 
 		 1197 aa  96.3  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  27.94 
 
 		 506 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  25.22 
 
 		 731 aa  94.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  26.78 
 
 		 3322 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  23.32 
 
 		 1602 aa  93.2  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.34 
 
 		 820 aa  89  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  24.91 
 
 		 747 aa  88.2  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.45 
 
 		 806 aa  83.2  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  24.52 
 
 		 961 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  30.13 
 
 		 861 aa  79.7  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  31.63 
 
 		 1254 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  25.18 
 
 		 1971 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  30.18 
 
 		 1252 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>