129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3067 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1036  AmoP  46.08 
 
 		 1882 aa  1479    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.678372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1602  hypothetical protein  63.45 
 
 		 753 aa  826    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3067  YD repeat protein  100 
 
 		 2003 aa  4138    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2663  hypothetical protein  54.35 
 
 		 702 aa  549  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.638234  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1600  hypothetical protein  69.06 
 
 		 607 aa  487  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  35.89 
 
 		 840 aa  280  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1935 aa  77.4  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.07 
 
 		 1464 aa  77.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  22.65 
 
 		 1600 aa  77  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.94 
 
 		 1485 aa  76.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  22.59 
 
 		 1681 aa  73.6  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.85 
 
 		 3027 aa  73.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 		 3273 aa  73.2  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.64 
 
 		 1467 aa  70.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  22.91 
 
 		 1520 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  22.48 
 
 		 1599 aa  70.1  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.08 
 
 		 1840 aa  68.6  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.73 
 
 		 1981 aa  68.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.14 
 
 		 1669 aa  67.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1917 aa  66.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  22.14 
 
 		 2731 aa  66.6  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  22.32 
 
 		 1352 aa  65.9  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1409 aa  64.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.14 
 
 		 2149 aa  63.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.38 
 
 		 1560 aa  64.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  22.89 
 
 		 1576 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.41 
 
 		 1429 aa  63.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  26.58 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  22.06 
 
 		 1384 aa  62.8  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1400 aa  62.8  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 		 3689 aa  62.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.08 
 
 		 1942 aa  62  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 2486 aa  61.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  22.48 
 
 		 1386 aa  62  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 972 aa  61.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  22.47 
 
 		 1547 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  28.62 
 
 		 1957 aa  60.5  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  22.31 
 
 		 1385 aa  60.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.27 
 
 		 1271 aa  60.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.69 
 
 		 2277 aa  59.7  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  26.4 
 
 		 740 aa  59.7  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.14 
 
 		 1959 aa  58.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  23.23 
 
 		 866 aa  58.9  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  26.61 
 
 		 1892 aa  58.9  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  24.42 
 
 		 1710 aa  58.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  22.69 
 
 		 1572 aa  58.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.08 
 
 		 2096 aa  58.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  22.54 
 
 		 1595 aa  58.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  22.79 
 
 		 2942 aa  57.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 1390 aa  58.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  23.96 
 
 		 2698 aa  57.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  27.17 
 
 		 1938 aa  57.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  22.64 
 
 		 1586 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  20.62 
 
 		 2035 aa  56.6  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 480 aa  56.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6263  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 939 aa  56.2  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 867 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.63 
 
 		 3193 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  24.38 
 
 		 2658 aa  55.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  23.96 
 
 		 1577 aa  55.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.02 
 
 		 1614 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  26.34 
 
 		 909 aa  53.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  26.42 
 
 		 335 aa  54.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.52 
 
 		 1611 aa  53.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  25.63 
 
 		 561 aa  53.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0130  Rhs family protein-like protein  35.23 
 
 		 303 aa  53.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  36.62 
 
 		 1338 aa  52.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  27.14 
 
 		 1530 aa  52.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.8 
 
 		 1348 aa  52.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  23.07 
 
 		 1509 aa  52.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  43.33 
 
 		 1626 aa  52.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  24.08 
 
 		 765 aa  52.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1147 aa  52.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 913 aa  51.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  27.62 
 
 		 1543 aa  51.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1552 aa  51.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1550 aa  51.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  22.83 
 
 		 1381 aa  50.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1527 aa  50.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  22.63 
 
 		 924 aa  50.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  27.89 
 
 		 788 aa  50.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  27.89 
 
 		 788 aa  50.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1551 aa  50.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1586 aa  50.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  26.27 
 
 		 583 aa  49.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  22.02 
 
 		 1568 aa  50.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 414 aa  49.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  26.51 
 
 		 934 aa  49.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1854 aa  49.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  27.98 
 
 		 2831 aa  49.3  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0412  YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 342 aa  48.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0858889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  42.62 
 
 		 171 aa  48.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.13 
 
 		 903 aa  48.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.68 
 
 		 1763 aa  48.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  22.66 
 
 		 1411 aa  48.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1487 aa  48.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  41.67 
 
 		 1620 aa  48.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  33.1 
 
 		 1953 aa  48.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1405 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0462  YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 352 aa  48.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.756225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>