169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0641 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0641  hypothetical protein  100 
 
 		 1566 aa  3167    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2507  hypothetical protein  28.33 
 
 		 834 aa  107  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.669353  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2506  hypothetical protein  61.11 
 
 		 461 aa  70.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.280474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  30.94 
 
 		 657 aa  56.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  34.52 
 
 		 711 aa  56.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  31.52 
 
 		 655 aa  55.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.49 
 
 		 706 aa  54.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  39.06 
 
 		 689 aa  53.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  38.71 
 
 		 506 aa  53.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  40 
 
 		 683 aa  53.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5549  type II and III secretion system protein  27.04 
 
 		 512 aa  53.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090409 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  28.3 
 
 		 636 aa  53.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  33.33 
 
 		 727 aa  53.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  28.3 
 
 		 630 aa  53.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  37.65 
 
 		 829 aa  53.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  36.49 
 
 		 541 aa  52.8  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  40.32 
 
 		 987 aa  52.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  34.57 
 
 		 710 aa  52  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  37.1 
 
 		 641 aa  52  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  39.06 
 
 		 689 aa  52  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0676  type IV pilus secretin PilQ  35.48 
 
 		 712 aa  51.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  35.94 
 
 		 642 aa  51.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0294  type IV pilus secretin PilQ  35.21 
 
 		 573 aa  51.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  39.06 
 
 		 706 aa  50.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 		 710 aa  50.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  35.94 
 
 		 715 aa  50.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1144  type IV pilus secretin PilQ  36.11 
 
 		 714 aa  50.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4188  type II and III secretion system protein  25.48 
 
 		 499 aa  50.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  32.89 
 
 		 692 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  35.21 
 
 		 591 aa  50.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  32 
 
 		 718 aa  50.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  32 
 
 		 718 aa  50.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  29.36 
 
 		 833 aa  49.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  26.92 
 
 		 1421 aa  49.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3132  putative type III secretion hypersensitivity response secretion protein, HrcC/HrpA1- like  30.99 
 
 		 736 aa  49.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15642  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  33.85 
 
 		 792 aa  49.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  31.58 
 
 		 686 aa  49.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4476  type II and III secretion system protein  25.48 
 
 		 499 aa  49.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.988373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  30.99 
 
 		 752 aa  50.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  33.8 
 
 		 784 aa  50.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  35.48 
 
 		 683 aa  50.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0078  general secretion pathway protein D  32.89 
 
 		 660 aa  49.7  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  33.85 
 
 		 756 aa  49.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  33.8 
 
 		 729 aa  49.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 		 668 aa  49.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  35.38 
 
 		 580 aa  49.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  40.32 
 
 		 684 aa  49.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  40.32 
 
 		 684 aa  49.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  40.32 
 
 		 682 aa  49.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  40.32 
 
 		 684 aa  49.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  36.92 
 
 		 685 aa  49.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  38.71 
 
 		 681 aa  49.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0045  type III secretion protein SctC  29.07 
 
 		 672 aa  49.3  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  40.32 
 
 		 684 aa  49.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  33.8 
 
 		 763 aa  49.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  40.32 
 
 		 683 aa  49.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  32.61 
 
 		 682 aa  48.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  40.32 
 
 		 808 aa  48.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  40.32 
 
 		 683 aa  49.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3088  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26 
 
 		 556 aa  49.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.994223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  40.32 
 
 		 683 aa  48.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  40.32 
 
 		 683 aa  48.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  28.21 
 
 		 698 aa  48.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  28.21 
 
 		 698 aa  48.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  34.72 
 
 		 704 aa  48.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  32.39 
 
 		 891 aa  48.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  37.1 
 
 		 688 aa  48.5  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  37.1 
 
 		 686 aa  48.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  33.33 
 
 		 711 aa  48.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  31.94 
 
 		 420 aa  48.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  33.87 
 
 		 751 aa  48.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  35.94 
 
 		 714 aa  48.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  31.4 
 
 		 426 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  37.1 
 
 		 686 aa  48.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  35.21 
 
 		 567 aa  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  35.53 
 
 		 745 aa  48.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 		 915 aa  48.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2716  Type IV pilus secretin PilQ  32.39 
 
 		 371 aa  48.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00921837  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  31.4 
 
 		 389 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3103  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26 
 
 		 514 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000610588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0474  YscC/HrcC family type III secretion outer membrane protein  35.44 
 
 		 683 aa  48.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  38.46 
 
 		 726 aa  48.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3051  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26 
 
 		 514 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.180372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  38.71 
 
 		 683 aa  48.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  37.1 
 
 		 686 aa  48.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3020  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26 
 
 		 514 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  31.94 
 
 		 420 aa  48.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3208  type III secretion outer membrane pore, YscC/HrcC family  26 
 
 		 514 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  37.1 
 
 		 686 aa  48.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  37.1 
 
 		 686 aa  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003337  type III secretion system outer membrane pore YscC  32.88 
 
 		 604 aa  48.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  31.4 
 
 		 426 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  31.4 
 
 		 412 aa  47.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.8 
 
 		 874 aa  47.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3488  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 		 543 aa  47.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  36.92 
 
 		 749 aa  47.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3688  type II and III secretion system protein  27.38 
 
 		 1469 aa  47.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  31.94 
 
 		 710 aa  47.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0391  type IV pilus secretin PilQ  32.39 
 
 		 543 aa  47.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  31.43 
 
 		 512 aa  47.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>