130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2416 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  32.66 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  39.13 
 
 		 159 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  38.73 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  32.24 
 
 		 185 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  39.44 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  40.43 
 
 		 170 aa  89.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  38.41 
 
 		 156 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  47.5 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  38.57 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  34.05 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  31.58 
 
 		 166 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  31.52 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  39.29 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  30.98 
 
 		 217 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  36.23 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  35.45 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  34.06 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  35.24 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  33.83 
 
 		 155 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  33.81 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  33.33 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  31.5 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  30.23 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  31.43 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  34.06 
 
 		 634 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  27.42 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0445  hypothetical protein  34.71 
 
 		 152 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  31.91 
 
 		 167 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  26.18 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  35.25 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  28.28 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  43.59 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  29.61 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  29.49 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  32.65 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0488  FHA domain containing protein  28.63 
 
 		 511 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  38.36 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  25.64 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  32.32 
 
 		 162 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  35.87 
 
 		 444 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  35.87 
 
 		 448 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  36.67 
 
 		 449 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  35.42 
 
 		 174 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  28.17 
 
 		 157 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  32.32 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  32.32 
 
 		 162 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  38.13 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  40 
 
 		 375 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2902  hypothetical protein  39.74 
 
 		 376 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  30.3 
 
 		 162 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 412 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  34.29 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 415 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 412 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  37.5 
 
 		 415 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  38.75 
 
 		 403 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4142  hypothetical protein  51.28 
 
 		 434 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2279  MJ0042 family finger-like protein  31.07 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.6329  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  27.56 
 
 		 191 aa  52.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  31.19 
 
 		 590 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  26.53 
 
 		 157 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  36.25 
 
 		 414 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  40.48 
 
 		 375 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  35.23 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4681  RDD domain-containing protein  32.74 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08450  hypothetical protein  43.4 
 
 		 360 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  33.57 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 424 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  34.38 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0800  hypothetical protein  47.17 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2662  hypothetical protein  54.29 
 
 		 490 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2123  hypothetical protein  39.68 
 
 		 426 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00645364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  30.43 
 
 		 200 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 536 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.08 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  36.67 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  32.2 
 
 		 327 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  29.79 
 
 		 335 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  25.89 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  28.28 
 
 		 165 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  33.57 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  26.06 
 
 		 154 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  28.28 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0446  hypothetical protein  32.21 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  32.2 
 
 		 176 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  30.21 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  31.43 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  30.68 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  33.11 
 
 		 171 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2181  hypothetical protein  40.91 
 
 		 437 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.729465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  29.79 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  34.15 
 
 		 141 aa  46.2  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21570  predicted membrane protein/domain  29.5 
 
 		 668 aa  46.2  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.497077  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0595  hypothetical protein  54.05 
 
 		 428 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000214517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  30.71 
 
 		 135 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1619  RDD  30.11 
 
 		 137 aa  45.8  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  29.61 
 
 		 159 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>