More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0403 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  44.82 
 
 		 1063 aa  894    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.1 
 
 		 1074 aa  973    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.9 
 
 		 1041 aa  670    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.95 
 
 		 1067 aa  877    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  73.64 
 
 		 1056 aa  1536    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  68.07 
 
 		 1052 aa  1472    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  35.23 
 
 		 1121 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  48.5 
 
 		 1057 aa  992    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  44.92 
 
 		 1063 aa  897    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  43.88 
 
 		 1044 aa  845    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  44.21 
 
 		 1063 aa  885    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  46.96 
 
 		 1060 aa  988    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  37.45 
 
 		 1039 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.14 
 
 		 1093 aa  909    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  45.25 
 
 		 1060 aa  956    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  46.57 
 
 		 1073 aa  979    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.13 
 
 		 1067 aa  868    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  44.92 
 
 		 1063 aa  895    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1069 aa  2179    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  43.9 
 
 		 1055 aa  877    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  44.31 
 
 		 1067 aa  885    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  46.77 
 
 		 1060 aa  944    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  44.27 
 
 		 1049 aa  860    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  44.4 
 
 		 1067 aa  887    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  43.79 
 
 		 1050 aa  865    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  46.96 
 
 		 1061 aa  956    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  44.77 
 
 		 1048 aa  894    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  43.62 
 
 		 1053 aa  866    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  44.4 
 
 		 1067 aa  886    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  68.5 
 
 		 1050 aa  1468    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  44.92 
 
 		 1063 aa  896    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  35.12 
 
 		 1052 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  35.83 
 
 		 1072 aa  600  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  35.27 
 
 		 1038 aa  591  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  34.85 
 
 		 1032 aa  591  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  33.11 
 
 		 1042 aa  578  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1068 aa  566  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1053 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1034 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1062 aa  548  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1051 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  32.03 
 
 		 1066 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.66 
 
 		 1054 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  32.34 
 
 		 1071 aa  499  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1041 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1054 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  32.06 
 
 		 1033 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.39 
 
 		 1060 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1040 aa  486  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 		 1053 aa  482  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  30.85 
 
 		 1048 aa  477  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1098 aa  479  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1043 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.93 
 
 		 1075 aa  476  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1053 aa  474  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1041 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  29.82 
 
 		 1053 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1054 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1033 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1033 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1036 aa  465  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1041 aa  466  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1035 aa  465  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1050 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  29.82 
 
 		 1034 aa  462  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1074 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1064 aa  446  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 		 1048 aa  446  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1063 aa  438  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 		 1030 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1035 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1030 aa  360  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 		 1131 aa  357  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1035 aa  354  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  27.26 
 
 		 1135 aa  348  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1092 aa  308  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  26.77 
 
 		 1005 aa  308  4.0000000000000004e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1137 aa  307  8.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1044 aa  304  5.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1055 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1038 aa  300  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  24.59 
 
 		 1044 aa  299  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  24.39 
 
 		 1050 aa  299  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.6 
 
 		 1070 aa  291  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  24.8 
 
 		 1095 aa  290  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1025 aa  290  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  24.61 
 
 		 1044 aa  288  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  24.5 
 
 		 1064 aa  286  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1058 aa  285  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 		 1034 aa  284  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.54 
 
 		 1050 aa  282  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1191 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  24.45 
 
 		 1143 aa  278  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  25.79 
 
 		 1025 aa  277  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  24.17 
 
 		 1028 aa  277  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25 
 
 		 1031 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.42 
 
 		 1046 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1022 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1063 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1031 aa  275  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>