112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3057 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
904 aa  1828    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  40.27 
 
 
868 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.22 
 
 
854 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  38.16 
 
 
960 aa  525  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 
851 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  36.71 
 
 
891 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  37 
 
 
950 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  36.89 
 
 
950 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  36 
 
 
853 aa  497  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 
885 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  35.68 
 
 
905 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 
905 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  35.07 
 
 
944 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  34.22 
 
 
840 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  32.42 
 
 
845 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
883 aa  327  9e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
822 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
796 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  32.14 
 
 
447 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  34.6 
 
 
1009 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  28.32 
 
 
725 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.73 
 
 
809 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.16 
 
 
957 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  27.75 
 
 
698 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.39 
 
 
3537 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  29.63 
 
 
553 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.77 
 
 
3298 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.44 
 
 
3419 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.5 
 
 
1772 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.44 
 
 
3535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.77 
 
 
3299 aa  149  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  26.51 
 
 
418 aa  144  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.61 
 
 
2637 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.83 
 
 
1650 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 
1060 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  30.4 
 
 
828 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
949 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.86 
 
 
991 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 
916 aa  98.2  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  30.19 
 
 
903 aa  97.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.14 
 
 
717 aa  96.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
1162 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 
1162 aa  94.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  30.48 
 
 
532 aa  91.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.7 
 
 
2741 aa  90.9  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  34.12 
 
 
192 aa  89.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
854 aa  89.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 
2741 aa  87.8  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  31.39 
 
 
893 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
1036 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
1409 aa  82.4  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
1215 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
968 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
1025 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.24 
 
 
919 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.01 
 
 
1328 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 
1365 aa  75.1  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 
729 aa  75.1  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  22.03 
 
 
1051 aa  74.7  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
937 aa  71.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.49 
 
 
1475 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
851 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1054 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  26.21 
 
 
884 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  38.68 
 
 
121 aa  66.6  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
928 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  22.66 
 
 
1025 aa  64.7  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  30 
 
 
1039 aa  63.9  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  34.44 
 
 
846 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  26.79 
 
 
565 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  26.77 
 
 
909 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  28.95 
 
 
1024 aa  59.7  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.38 
 
 
2145 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.24 
 
 
1468 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  28.81 
 
 
1246 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 
1186 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 
1266 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.75 
 
 
937 aa  54.7  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  26.36 
 
 
1077 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  27.81 
 
 
827 aa  53.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  26.63 
 
 
1051 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  22.87 
 
 
799 aa  51.6  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  22.76 
 
 
989 aa  51.6  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.42 
 
 
1238 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.03 
 
 
782 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  22.14 
 
 
1180 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
923 aa  50.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  21.1 
 
 
1805 aa  49.3  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
714 aa  49.3  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
1261 aa  49.3  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  33.33 
 
 
811 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.65 
 
 
985 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
1711 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 
1028 aa  48.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  26.62 
 
 
883 aa  48.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 
1055 aa  48.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  26.51 
 
 
1228 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 
1276 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
1714 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  25 
 
 
689 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>