More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2322 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 		 1444 aa  2909    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  43.29 
 
 		 1142 aa  660    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  41.72 
 
 		 1182 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  42.64 
 
 		 1143 aa  693    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  58.34 
 
 		 1505 aa  1152    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  43.9 
 
 		 1151 aa  684    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  43.2 
 
 		 1135 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  40.85 
 
 		 1138 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  48.12 
 
 		 1200 aa  993    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.19 
 
 		 945 aa  702    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.28 
 
 		 953 aa  626  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 800 aa  509  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  37.31 
 
 		 1194 aa  493  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  43.66 
 
 		 941 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  41.23 
 
 		 918 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  41.6 
 
 		 909 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  38.42 
 
 		 918 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  39.25 
 
 		 984 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  38.82 
 
 		 908 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  57.08 
 
 		 392 aa  273  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1732  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 232 aa  265  6e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7276  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 272 aa  235  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.127431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0731  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.14 
 
 		 245 aa  222  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4674  hypothetical protein  44.59 
 
 		 279 aa  204  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.929518  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1372  sigma-70 factor  44.54 
 
 		 247 aa  203  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10102  normal  0.203538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1804  hypothetical protein  47.09 
 
 		 276 aa  201  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1220  sigma-70 factor  42.17 
 
 		 260 aa  197  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0178676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4526  sigma-70 factor  45.37 
 
 		 255 aa  195  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2016  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  192  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  47.47 
 
 		 895 aa  191  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2320  hypothetical protein  42.37 
 
 		 375 aa  184  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  29.4 
 
 		 1029 aa  172  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  27.19 
 
 		 1081 aa  170  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  37.92 
 
 		 285 aa  152  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  30.11 
 
 		 841 aa  148  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0069  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 277 aa  144  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1803  hypothetical protein  33.46 
 
 		 292 aa  142  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02570  glycosyl-hydrolase, putative  32.82 
 
 		 346 aa  131  8.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  41.03 
 
 		 212 aa  131  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  26.89 
 
 		 999 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  26.89 
 
 		 999 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.39 
 
 		 892 aa  123  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  26.71 
 
 		 999 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4608  hypothetical protein  33.17 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.44 
 
 		 1657 aa  115  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2908  putative secreted glycosyl hydrolase  29.06 
 
 		 266 aa  108  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  33.33 
 
 		 231 aa  104  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2243  protein of unknown function DUF1080  34.86 
 
 		 884 aa  103  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  23.87 
 
 		 1132 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  30.23 
 
 		 387 aa  93.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1382  glycosyl hydrolase  28.86 
 
 		 296 aa  92  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  30.49 
 
 		 482 aa  90.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.16 
 
 		 442 aa  89.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2820  hypothetical protein  26.82 
 
 		 306 aa  87.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  hitchhiker  0.00217899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 389 aa  87  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  32.92 
 
 		 894 aa  87  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.09 
 
 		 412 aa  86.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  29.32 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  27.8 
 
 		 475 aa  84  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  30.15 
 
 		 374 aa  83.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  28.09 
 
 		 373 aa  83.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  38.28 
 
 		 501 aa  83.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  41.4 
 
 		 816 aa  82.4  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  28.97 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  36.22 
 
 		 490 aa  81.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  40.16 
 
 		 541 aa  81.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  38.76 
 
 		 951 aa  80.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  29.73 
 
 		 371 aa  80.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.88 
 
 		 601 aa  80.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  27.91 
 
 		 371 aa  80.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 371 aa  80.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 371 aa  80.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.37 
 
 		 371 aa  80.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  27.91 
 
 		 371 aa  80.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  28.37 
 
 		 371 aa  80.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4740  putative secreted glycosyl hydrolase  25.99 
 
 		 255 aa  79.7  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195293  hitchhiker  0.002769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.37 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.2 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  28.37 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  37.8 
 
 		 536 aa  79.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.15 
 
 		 1171 aa  78.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  27.05 
 
 		 386 aa  78.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29.05 
 
 		 2172 aa  78.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  25.34 
 
 		 342 aa  78.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  22.14 
 
 		 972 aa  78.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.37 
 
 		 713 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  35.56 
 
 		 658 aa  77.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  34.29 
 
 		 675 aa  77.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  27.76 
 
 		 388 aa  77.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  31.88 
 
 		 679 aa  76.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  39.84 
 
 		 1667 aa  76.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  27.81 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  38.58 
 
 		 604 aa  75.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1328  glucose sorbosone dehydrogenase  26.99 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.23 
 
 		 1503 aa  75.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  36.22 
 
 		 1015 aa  75.5  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  39.84 
 
 		 2122 aa  75.5  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 		 1265 aa  75.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  35.07 
 
 		 884 aa  75.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  37.69 
 
 		 928 aa  75.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>