139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1273 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 510 aa  1028    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.97 
 
 		 831 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  32 
 
 		 638 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  34.95 
 
 		 570 aa  94  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  29.88 
 
 		 892 aa  90.1  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.65 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  28.86 
 
 		 648 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  31.15 
 
 		 820 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  27.71 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  26.9 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.17 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.17 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.17 
 
 		 416 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  30 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  29.71 
 
 		 940 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  29.75 
 
 		 805 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  26.42 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  26.26 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  27.86 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.25 
 
 		 400 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  31.04 
 
 		 677 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  24.81 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  24 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  27.62 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  26.29 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  26.6 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  36.53 
 
 		 647 aa  70.5  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  26.6 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  30.86 
 
 		 1628 aa  70.5  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  26.32 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  26.32 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  23.67 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  28.44 
 
 		 871 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  31.47 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  29.5 
 
 		 641 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  27.73 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  28.15 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  25.07 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  26.67 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  26.52 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  30.87 
 
 		 1332 aa  64.3  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  31.25 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.22 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.79 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  27.63 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.62 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.91 
 
 		 458 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  23.93 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  23.7 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  25.53 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  26.67 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  23.54 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  24.04 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.17 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  30.5 
 
 		 735 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  30.08 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  25.51 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 674 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.62 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  35.11 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  25.71 
 
 		 452 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  31.48 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  26.13 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  27.34 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  31.14 
 
 		 1200 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  26.34 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  27.84 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  25.85 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  23.89 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  25.65 
 
 		 724 aa  57.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  22.96 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  26.37 
 
 		 405 aa  57  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1121 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.28 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  23.53 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  27 
 
 		 972 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  38.64 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  23.77 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  23.5 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  28.45 
 
 		 635 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  29.88 
 
 		 899 aa  55.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  28.99 
 
 		 707 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  22.93 
 
 		 439 aa  53.9  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  25.57 
 
 		 960 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.36 
 
 		 467 aa  53.5  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  26.01 
 
 		 768 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  24.81 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  27.27 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  26.92 
 
 		 5453 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6675  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.52 
 
 		 497 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.500799  normal  0.284088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  22.69 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  25.3 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.65 
 
 		 685 aa  50.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.46 
 
 		 594 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1600  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  29.23 
 
 		 539 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.911541  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  25.71 
 
 		 975 aa  50.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1421  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.63 
 
 		 255 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.670143  normal  0.74275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18500  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  29.23 
 
 		 543 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0371446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1283  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.12 
 
 		 557 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.465255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  26.13 
 
 		 308 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>