187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6293 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  100 
 
 		 344 aa  702    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  45.89 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  45.56 
 
 		 349 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  40.82 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  39.53 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  41.3 
 
 		 360 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  41.72 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3025  integrase family protein  36.84 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.282849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  37.71 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  36.92 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  32.53 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  30.54 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  29.32 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  28.49 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  29.14 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  27.74 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  29.91 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0617  phage integrase  31.91 
 
 		 383 aa  93.6  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 335 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0136  putative integrase for prophage CP-933U  30.53 
 
 		 277 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.872281  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  29.17 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  25.87 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  26.63 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  25.87 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  29.23 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  25.57 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1931  hypothetical protein  28.11 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00772625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  24.42 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2653  integrase family protein  25.93 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  23.2 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  28.44 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3883  putative site-specific integrase/recombinase  66.67 
 
 		 66 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.353137  normal  0.0700878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  26.41 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  30.04 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  30.04 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  25.37 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  25.1 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1741  Phage integrase  28.57 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  33.03 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  33.03 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  26.24 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  25.33 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  23.57 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  26.54 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  29.84 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  23.34 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  28.85 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  32.62 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  26.09 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  24.59 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  23.7 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  31.22 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  35.62 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  30.15 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  37.27 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  31.25 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  25.52 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  30.6 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  28.24 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  32.14 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  33.87 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  28 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  40.16 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  26.94 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  37.04 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  26.02 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4252  integrase family protein  38.54 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.354411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  28.08 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  31.58 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  36.11 
 
 		 342 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  24.17 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  36.51 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  26.04 
 
 		 426 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  30.46 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.47 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  33.33 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  28.64 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  26.81 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  27.06 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  31.03 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25.76 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 200 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  29.84 
 
 		 164 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1375  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  24.74 
 
 		 222 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  28.27 
 
 		 454 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.72 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  29.05 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  28.35 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>