122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4515 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  430  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  84.86 
 
 		 215 aa  350  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1636  TetR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0734  putative transcriptional regulator, TetR family  41.09 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0676  putative transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1500  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.570959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1779  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1344  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  27.13 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004024  transcriptional regulator  26.6 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1003  putative HTH-type transcriptional regulator  21.79 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01438  hypothetical protein  24.47 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1605  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72373  hitchhiker  0.0000763584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  25.91 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0186  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.240473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0132  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0172  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0121  putative transcriptional regulator, TetR family protein  25.97 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.778342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4185  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  23.53 
 
 		 175 aa  48.5  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 237 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  24.12 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  36.52 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  33.04 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2322  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.850071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0233  hypothetical protein  34.85 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  19.66 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  36.99 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  23.18 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  25.2 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  30.99 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>