276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2744 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  100 
 
 		 860 aa  1730    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  47.05 
 
 		 881 aa  713    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  77.43 
 
 		 865 aa  1333    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  42.69 
 
 		 877 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.45 
 
 		 905 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.22 
 
 		 764 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1083 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.13 
 
 		 816 aa  144  8e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  23.44 
 
 		 872 aa  140  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  25.5 
 
 		 835 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  25.79 
 
 		 1051 aa  130  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20 
 
 		 813 aa  127  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.2 
 
 		 807 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.22 
 
 		 837 aa  125  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  19.23 
 
 		 821 aa  121  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.55 
 
 		 779 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  25.21 
 
 		 800 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.99 
 
 		 807 aa  118  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  23.68 
 
 		 779 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.15 
 
 		 824 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  26.25 
 
 		 755 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  24.83 
 
 		 756 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  20.38 
 
 		 815 aa  110  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20 
 
 		 831 aa  108  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  19.63 
 
 		 823 aa  107  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  25.12 
 
 		 792 aa  107  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.81 
 
 		 898 aa  105  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.1 
 
 		 861 aa  105  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  17.49 
 
 		 821 aa  103  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  19.66 
 
 		 823 aa  103  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.2 
 
 		 808 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  19.32 
 
 		 823 aa  101  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.85 
 
 		 815 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.94 
 
 		 764 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  27.76 
 
 		 792 aa  99.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  27.3 
 
 		 778 aa  99.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  26.14 
 
 		 751 aa  95.9  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  22.93 
 
 		 808 aa  95.1  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.35 
 
 		 773 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  27.86 
 
 		 811 aa  90.1  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  19.87 
 
 		 806 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  21.74 
 
 		 796 aa  88.2  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  18.75 
 
 		 767 aa  86.7  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  20.6 
 
 		 830 aa  85.1  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  21.13 
 
 		 790 aa  85.1  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  22.09 
 
 		 799 aa  84.3  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  25.41 
 
 		 869 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  25.41 
 
 		 869 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  22.63 
 
 		 797 aa  81.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  22.25 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.46 
 
 		 717 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.61 
 
 		 674 aa  78.6  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  21.32 
 
 		 674 aa  78.6  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  23.93 
 
 		 788 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  20.92 
 
 		 387 aa  77  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  23.99 
 
 		 788 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.54 
 
 		 803 aa  74.7  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  23.67 
 
 		 765 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  20 
 
 		 804 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  25.78 
 
 		 825 aa  72.4  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.31 
 
 		 789 aa  71.6  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.01 
 
 		 723 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  28.75 
 
 		 859 aa  71.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  22.71 
 
 		 789 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  28.48 
 
 		 1204 aa  70.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  25.36 
 
 		 763 aa  69.3  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  21.33 
 
 		 689 aa  68.9  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  29.63 
 
 		 692 aa  67.8  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  21.99 
 
 		 805 aa  67.4  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  21.85 
 
 		 789 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  21.99 
 
 		 806 aa  67.4  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  22.68 
 
 		 727 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  24.13 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  23.68 
 
 		 786 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  22.72 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  20.23 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  22.72 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  23.19 
 
 		 786 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  19.65 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.26 
 
 		 762 aa  63.9  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.99 
 
 		 801 aa  64.3  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  23.28 
 
 		 769 aa  63.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  22.74 
 
 		 785 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  25.95 
 
 		 895 aa  64.3  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  22.9 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  18.47 
 
 		 385 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  22.22 
 
 		 784 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  20.89 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.82 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  21.62 
 
 		 796 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.25 
 
 		 804 aa  62  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  25.91 
 
 		 1011 aa  61.6  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  22.22 
 
 		 786 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  20.52 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  29.11 
 
 		 849 aa  61.2  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  20.92 
 
 		 796 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  23.47 
 
 		 771 aa  60.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.99 
 
 		 1109 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  20 
 
 		 834 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  21.49 
 
 		 821 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>