More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1203 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  100 
 
 
1065 aa  2192    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  37.48 
 
 
1078 aa  644    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  38.71 
 
 
1075 aa  676    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  36.29 
 
 
1069 aa  665    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  41.59 
 
 
1075 aa  684    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  36.19 
 
 
1078 aa  656    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  36.21 
 
 
1077 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  38.17 
 
 
1082 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  36.74 
 
 
1077 aa  644    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  40.61 
 
 
1083 aa  746    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  40.39 
 
 
1067 aa  740    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  37.29 
 
 
1075 aa  651    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  37.58 
 
 
1071 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  37.86 
 
 
1074 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  36.74 
 
 
1090 aa  643    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  39.35 
 
 
1089 aa  725    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  36.93 
 
 
1065 aa  669    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  40.84 
 
 
1081 aa  754    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.25 
 
 
1085 aa  696    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  56.38 
 
 
1053 aa  1208    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  37.58 
 
 
1077 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  39.98 
 
 
1072 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  37.6 
 
 
1087 aa  678    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  36.82 
 
 
1064 aa  633  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  35.89 
 
 
1112 aa  621  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 
696 aa  343  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  28.73 
 
 
1016 aa  227  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  27.63 
 
 
1131 aa  212  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  27.16 
 
 
1124 aa  210  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  27.27 
 
 
1153 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  27.17 
 
 
1143 aa  197  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  27.3 
 
 
1051 aa  180  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  26.54 
 
 
1052 aa  174  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  26.72 
 
 
1080 aa  170  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  25.45 
 
 
1086 aa  169  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.38 
 
 
1128 aa  167  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  26.55 
 
 
1140 aa  165  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  28.83 
 
 
1109 aa  163  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  27 
 
 
1086 aa  150  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  23.23 
 
 
1086 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  25 
 
 
853 aa  138  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  24.93 
 
 
1099 aa  137  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  25.08 
 
 
1100 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  22.51 
 
 
1127 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  27.29 
 
 
1109 aa  128  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  24.9 
 
 
1125 aa  122  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  24.5 
 
 
1065 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0360  hypothetical protein  50.51 
 
 
108 aa  105  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000114826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  28.16 
 
 
1153 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  24.78 
 
 
932 aa  95.9  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  24.75 
 
 
929 aa  91.7  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.84 
 
 
1170 aa  89  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  30.33 
 
 
1013 aa  85.1  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  37.69 
 
 
1043 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  25.99 
 
 
1060 aa  81.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  29.49 
 
 
1122 aa  81.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.84 
 
 
1147 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  31.98 
 
 
946 aa  80.1  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  28.04 
 
 
1187 aa  78.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  24.29 
 
 
1117 aa  78.2  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  29.82 
 
 
1169 aa  77.4  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  32 
 
 
1037 aa  77  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.46 
 
 
1172 aa  77  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  29.02 
 
 
950 aa  76.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  29.02 
 
 
760 aa  75.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 
1169 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.89 
 
 
1144 aa  74.3  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  30.89 
 
 
835 aa  74.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.17 
 
 
1160 aa  73.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  31.51 
 
 
1065 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  31.51 
 
 
1065 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  23.91 
 
 
1082 aa  72  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  28.64 
 
 
940 aa  71.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.18 
 
 
1170 aa  71.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  28.72 
 
 
813 aa  71.6  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  30.41 
 
 
1168 aa  70.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  29.6 
 
 
1172 aa  71.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  28.07 
 
 
972 aa  70.5  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  27.33 
 
 
829 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  22.45 
 
 
952 aa  70.5  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.03 
 
 
1145 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.8 
 
 
969 aa  70.1  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.55 
 
 
933 aa  70.1  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  28.76 
 
 
948 aa  70.1  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.69 
 
 
1170 aa  70.1  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  31.03 
 
 
951 aa  69.7  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  27.32 
 
 
910 aa  69.7  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  34.56 
 
 
774 aa  69.7  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  26.78 
 
 
964 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  24.92 
 
 
1069 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  24.92 
 
 
1069 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  29.01 
 
 
1046 aa  69.3  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.45 
 
 
1212 aa  68.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  35 
 
 
1194 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  24.54 
 
 
724 aa  68.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  28.16 
 
 
915 aa  68.2  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  29.12 
 
 
584 aa  68.2  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  35.38 
 
 
966 aa  68.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  32.03 
 
 
969 aa  68.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  33.1 
 
 
933 aa  67.4  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>