190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2198 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2198  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4498  TetR family transcriptional regulator  77.63 
 
 		 220 aa  324  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1303  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  72.46 
 
 		 228 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  72.46 
 
 		 228 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  71.5 
 
 		 228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11243  transcriptional regulator  66.67 
 
 		 212 aa  285  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0445311  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1396  TetR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  51.26 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3548  transcriptional regulator, TetR family  45.67 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0228014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  44.88 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  40.09 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0144  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16540  transcriptional regulator, tetR family  40.28 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3756  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  43.12 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3200  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 237 aa  99.4  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 215 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3567  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2369  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2758  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524358  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0261  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  60.78 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  46.15 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  62.79 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  47.46 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4118  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  34.78 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1439  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.187037  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  34.69 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  56.1 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  46 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  36.75 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5058  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>