More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0366 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  79.26 
 
 		 190 aa  298  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  27.75 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  25.79 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  31.62 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.14 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  35.23 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 181 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 182 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>