More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl155 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl155  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0665  tRNA pseudouridine synthase A  56.5 
 
 		 249 aa  258  6e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  33.21 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  30.47 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  26.8 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0975  tRNA pseudouridine synthase A  35.89 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.892125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  33.46 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  33.46 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  29.53 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.07 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17151  tRNA pseudouridine synthase A  31.23 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.137278  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2111  tRNA pseudouridine synthase A  30.28 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.110217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  32.14 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1600  tRNA pseudouridine synthase A  28.35 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535619  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  28.17 
 
 		 271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  28.96 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1634  tRNA pseudouridine synthase A  27.95 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1916  tRNA pseudouridine synthase A  27.95 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0844  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0914  tRNA pseudouridine synthase A  32.79 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.992712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  27.56 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1186  tRNA pseudouridine synthase A  32.94 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0288675  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17411  tRNA pseudouridine synthase A  32.03 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  31.71 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  31.25 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  31.71 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  30.36 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  29.25 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3871  tRNA pseudouridine synthase A  28.4 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17251  tRNA pseudouridine synthase A  30.47 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0248  tRNA pseudouridine synthase A  28.46 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262775 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1064  tRNA pseudouridine synthase A  32.94 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  27.67 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2616  tRNA pseudouridine synthase A  25.1 
 
 		 296 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  29.55 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1355  tRNA pseudouridine synthase A  30.52 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0794079  normal  0.0223344 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  29.69 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0612  tRNA pseudouridine synthase A  26.85 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0699  tRNA pseudouridine synthase A  29.48 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  30.1 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1426  tRNA pseudouridine synthase A  31.08 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000043766  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23260  pseudouridylate synthase I  26.81 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  30.1 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0627  tRNA pseudouridine synthase A  30 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3380  tRNA pseudouridine synthase A  27.34 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  24.6 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4476  tRNA pseudouridine synthase A  28.4 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6020  tRNA pseudouridine synthase A  25.1 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0748411  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  31.32 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  28.17 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0056  tRNA pseudouridine synthase A  27.84 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  27.53 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  32.93 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  25.69 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0675  tRNA pseudouridine synthase A  30.19 
 
 		 245 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0747  tRNA pseudouridine synthase A  29.93 
 
 		 258 aa  101  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4667  tRNA pseudouridine synthase A  31.2 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  28.78 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  27.6 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1259  tRNA pseudouridine synthase A  26.42 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  25.1 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  27.6 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  27.27 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  26.59 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  32.52 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  28 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  26.64 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  26.98 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1916  tRNA pseudouridine synthase A  24.71 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.974239 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  25 
 
 		 351 aa  99.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2800  tRNA pseudouridine synthase A  26.79 
 
 		 283 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.86 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1123  tRNA pseudouridine synthase A  29.44 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0266785  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  25.4 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  29.15 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  28.17 
 
 		 263 aa  98.6  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  25.32 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.89 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  26.09 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0079  tRNA pseudouridine synthase A  28.71 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.594696  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4747  tRNA pseudouridine synthase A  27.56 
 
 		 254 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.8 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  27.32 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  24.57 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1438  tRNA pseudouridine synthase A  26.92 
 
 		 299 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  26.32 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1380  tRNA pseudouridine synthase A  29.88 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  27.32 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  28.17 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0973  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 		 278 aa  97.8  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.607139  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5154  tRNA pseudouridine synthase A  27.85 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0627  tRNA pseudouridine synthase A  28.23 
 
 		 245 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.801846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  26.19 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  26.85 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  28.05 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1104  tRNA pseudouridine synthase A  26.38 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.723318  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  31.89 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0389  tRNA pseudouridine synthase A  28.19 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  27.52 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>