More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0973 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0973  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 278 aa  568  1e-161  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.607139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0699  tRNA pseudouridine synthase A  50.36 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148099  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1426  tRNA pseudouridine synthase A  46.01 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000043766  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0747  tRNA pseudouridine synthase A  46.42 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1186  tRNA pseudouridine synthase A  42.75 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0288675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0914  tRNA pseudouridine synthase A  41.67 
 
 		 240 aa  203  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.992712  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0844  tRNA pseudouridine synthase A  41.67 
 
 		 241 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0975  tRNA pseudouridine synthase A  41.24 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.892125  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0994  pseudouridylate synthase  34.66 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1128  tRNA pseudouridine synthase A  31.67 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  30.9 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  30.07 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3828  tRNA pseudouridine synthase A  31.41 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1444  tRNA pseudouridine synthase A  34.98 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  30 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1544  tRNA pseudouridine synthase A  30.95 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2322  tRNA pseudouridine synthase A  31.43 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  33.96 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  26.45 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  33.96 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2410  tRNA pseudouridine synthase A  31.43 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.293969  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  29.6 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  33 
 
 		 261 aa  99.8  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  32.37 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  31.66 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  26.81 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  29.7 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1175  tRNA pseudouridine synthase A  34.48 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.261971  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  28.89 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3352  pseudouridylate synthase  30.2 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  31.86 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl155  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  27.56 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  33.99 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  30.69 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  28.7 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2585  tRNA pseudouridine synthase A  25.58 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  27.8 
 
 		 244 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2269  tRNA-pseudouridine synthase I  29.19 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.584541  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2207  tRNA pseudouridine synthase A  26.07 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.02 
 
 		 244 aa  95.5  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1355  tRNA pseudouridine synthase A  31.84 
 
 		 237 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0794079  normal  0.0223344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  24.82 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4942  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.92 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  31.25 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3729  tRNA pseudouridine synthase A  28.14 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  32.02 
 
 		 245 aa  93.2  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.28 
 
 		 245 aa  92.8  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0841  tRNA pseudouridine synthase A  27.49 
 
 		 305 aa  92.4  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.86 
 
 		 245 aa  92.4  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 		 252 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0627  tRNA pseudouridine synthase A  28.31 
 
 		 241 aa  92.4  8e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17151  tRNA pseudouridine synthase A  30.7 
 
 		 268 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.137278  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  29.47 
 
 		 253 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  26.56 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  29.58 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  29.05 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  30.05 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  29.91 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  30.29 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0364  tRNA pseudouridine synthase A  32.67 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  30.05 
 
 		 248 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  28.38 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  29.8 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  30.29 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  30.29 
 
 		 252 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1018  pseudouridylate synthase  33.84 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0079  tRNA pseudouridine synthase A  30.85 
 
 		 245 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.594696  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  30.29 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  30.29 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  30.29 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  30.29 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  30.1 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  29.17 
 
 		 268 aa  89  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0675  tRNA pseudouridine synthase A  30.85 
 
 		 245 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1033  tRNA pseudouridine synthase A  28.14 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1916  tRNA pseudouridine synthase A  28.16 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.974239 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  32.39 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  25.63 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3695  tRNA pseudouridine synthase A  26.62 
 
 		 245 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  25.18 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0974  tRNA pseudouridine synthase A  28.14 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.61 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  27.11 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1368  tRNA pseudouridine synthase A  29.67 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  28.86 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  32.23 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1600  tRNA pseudouridine synthase A  28.99 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535619  normal  0.0774828 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  27.59 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1444  tRNA pseudouridine synthase A  29.06 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  29.67 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  30.39 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1123  tRNA pseudouridine synthase A  26.91 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0266785  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4238  tRNA pseudouridine synthase A  30.54 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  28.45 
 
 		 261 aa  87  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0627  tRNA pseudouridine synthase A  30.35 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.801846  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  29.67 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>