More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1186 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1186  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0288675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0914  tRNA pseudouridine synthase A  96.67 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.992712  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0844  tRNA pseudouridine synthase A  96.68 
 
 		 241 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0975  tRNA pseudouridine synthase A  59.17 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.892125  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1426  tRNA pseudouridine synthase A  52.08 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000043766  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0699  tRNA pseudouridine synthase A  49.17 
 
 		 243 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148099  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0747  tRNA pseudouridine synthase A  43.63 
 
 		 258 aa  208  5e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0973  tRNA pseudouridine synthase A  42.75 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.607139  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0994  pseudouridylate synthase  39.09 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1128  tRNA pseudouridine synthase A  35.37 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  31.6 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  32.41 
 
 		 265 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  32.4 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  35.34 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  35.34 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  30.65 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  31.87 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  29.39 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  31.3 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl155  tRNA pseudouridine synthase A  32.94 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  30.49 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1444  tRNA pseudouridine synthase A  32.24 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  33.86 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.44 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  31.6 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  31.15 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.03 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.89 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4942  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.55 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  30.49 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.45 
 
 		 244 aa  105  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  31.3 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  28.57 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  28.57 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  28.34 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  31.47 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  28.28 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  28.28 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  28.28 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  28.28 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  28.28 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  28.63 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  29.34 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  30.52 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  29.63 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  31.2 
 
 		 247 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  33.07 
 
 		 245 aa  101  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  30.4 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0483  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  32.05 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  27.98 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0627  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  30.12 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  30.2 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04290  pseudouridylate synthase I  26.89 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  30.2 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  27.42 
 
 		 270 aa  99  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  31.73 
 
 		 250 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  28.28 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  27.42 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  27.76 
 
 		 252 aa  98.2  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2585  tRNA pseudouridine synthase A  28.46 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  27.02 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  29.76 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  27.42 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  29.67 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  27.53 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0389  tRNA pseudouridine synthase A  28.85 
 
 		 265 aa  96.3  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  27.87 
 
 		 261 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1355  tRNA pseudouridine synthase A  31.3 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0794079  normal  0.0223344 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  31.33 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  26.77 
 
 		 274 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  27.53 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  27.53 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  25.9 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  27.53 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3828  tRNA pseudouridine synthase A  30.2 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  27.53 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1380  tRNA pseudouridine synthase A  29.84 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  27.35 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  29.75 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  25.9 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  26.91 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  27.13 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  27.53 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  28.17 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16531  tRNA pseudouridine synthase A  28.98 
 
 		 289 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0673067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  29.6 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  27.82 
 
 		 267 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  27.13 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>