More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0699 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0699  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 243 aa  503  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148099  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1426  tRNA pseudouridine synthase A  68.88 
 
 		 241 aa  355  2.9999999999999997e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000043766  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0975  tRNA pseudouridine synthase A  49.79 
 
 		 244 aa  247  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.892125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1186  tRNA pseudouridine synthase A  49.17 
 
 		 241 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0288675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0914  tRNA pseudouridine synthase A  48.75 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.992712  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0973  tRNA pseudouridine synthase A  50.36 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.607139  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0844  tRNA pseudouridine synthase A  48.33 
 
 		 241 aa  238  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0747  tRNA pseudouridine synthase A  50.97 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0994  pseudouridylate synthase  37.34 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1128  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  34.65 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 		 258 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  35.77 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1444  tRNA pseudouridine synthase A  32.79 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.33 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3828  tRNA pseudouridine synthase A  32.23 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  35.08 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  30.8 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.89 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  35.08 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.97 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.3 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  31.98 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  34.27 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  34.27 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  34.27 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  34.27 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  34.27 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.47 
 
 		 270 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl155  tRNA pseudouridine synthase A  29.48 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  29.73 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  29.73 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  31.58 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  32.65 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  31.75 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  30.33 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.24 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  31.25 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0627  tRNA pseudouridine synthase A  30.65 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1355  tRNA pseudouridine synthase A  31.25 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0794079  normal  0.0223344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  33.46 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  29.72 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.62 
 
 		 245 aa  101  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  32 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1368  tRNA pseudouridine synthase A  29.37 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  32.94 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1051  tRNA pseudouridine synthase A  32.44 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.238902 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  30.77 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  29.72 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1815  tRNA pseudouridine synthase A  30.47 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1018  pseudouridylate synthase  32.13 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0807  tRNA pseudouridine synthase A  31.56 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  31.58 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  29.96 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1800  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 267 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  29.55 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  28.79 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  30.2 
 
 		 244 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  30.8 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0627  tRNA pseudouridine synthase A  32.38 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.801846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  30.8 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3066  tRNA pseudouridine synthase A  31.02 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301608  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0079  tRNA pseudouridine synthase A  31.97 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.594696  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2469  tRNA pseudouridine synthase A  31.76 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.371859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0675  tRNA pseudouridine synthase A  32.38 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  30.4 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2308  tRNA pseudouridine synthase A  29.88 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.742773  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1380  tRNA pseudouridine synthase A  29.92 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7335  tRNA pseudouridine synthase A  30.74 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  30.71 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  31.43 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2576  tRNA pseudouridine synthase A  30.99 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  30.14 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1123  tRNA pseudouridine synthase A  29.29 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0266785  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  29.03 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  29.76 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  32.66 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  30.08 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  28.8 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  28.46 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0770  tRNA pseudouridine synthase A  30.65 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  29.03 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0389  tRNA pseudouridine synthase A  31.13 
 
 		 265 aa  93.6  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  29.03 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  29.1 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0665  tRNA pseudouridine synthase A  31.85 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2714  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.77 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.971768  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  29.03 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  29.1 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>