More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0914 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0914  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.992712  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0844  tRNA pseudouridine synthase A  97.5 
 
 		 241 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1186  tRNA pseudouridine synthase A  96.67 
 
 		 241 aa  472  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0288675  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0975  tRNA pseudouridine synthase A  59.17 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.892125  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1426  tRNA pseudouridine synthase A  51.67 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000043766  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0699  tRNA pseudouridine synthase A  48.75 
 
 		 243 aa  242  5e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148099  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0747  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0973  tRNA pseudouridine synthase A  41.67 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.607139  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0994  pseudouridylate synthase  39.92 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1128  tRNA pseudouridine synthase A  34.29 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  33.74 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  31.3 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  31.38 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  29.51 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  35.37 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  32.11 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  35.37 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  29.51 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  29.51 
 
 		 247 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  31.56 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl155  tRNA pseudouridine synthase A  32.79 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4942  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.44 
 
 		 272 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  33.61 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  29.34 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.51 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  31.28 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1444  tRNA pseudouridine synthase A  31.82 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  30.08 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  30.17 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  30.86 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.15 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  32.13 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  29.84 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  29.84 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  29.84 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  29.84 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  29.84 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.86 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  29.84 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  29.84 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  31.17 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  27.27 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04290  pseudouridylate synthase I  27.27 
 
 		 300 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  29.96 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  31.05 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4372  tRNA pseudouridine synthase A  28.86 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  27.5 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.46 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  30.49 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  31.89 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  28.93 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0483  tRNA pseudouridine synthase A  32.92 
 
 		 248 aa  99.4  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  29.58 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  29.84 
 
 		 270 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.05 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  31.84 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  29.75 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  30.89 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0627  tRNA pseudouridine synthase A  30.33 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  29.75 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6844  tRNA pseudouridine synthase A  27.82 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000523123  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2585  tRNA pseudouridine synthase A  28.05 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2883  tRNA pseudouridine synthase A  27.42 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0101662  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  26.91 
 
 		 274 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  26.83 
 
 		 270 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1355  tRNA pseudouridine synthase A  31.54 
 
 		 237 aa  95.9  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0794079  normal  0.0223344 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  27.57 
 
 		 252 aa  95.1  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  27.69 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  27.98 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1123  tRNA pseudouridine synthase A  29.58 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0266785  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  29.63 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  27.35 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  28.23 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  28.23 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  27.08 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  27.08 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  27.08 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  27.87 
 
 		 261 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1985  tRNA pseudouridine synthase A  25.7 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  30.33 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2502  tRNA pseudouridine synthase A  27.87 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419434  normal  0.63805 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1051  tRNA pseudouridine synthase A  29.76 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000873816  hitchhiker  0.00519599 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  27.64 
 
 		 261 aa  92.4  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  27.64 
 
 		 261 aa  92.4  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0744  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  27.64 
 
 		 259 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0785  tRNA pseudouridine synthase A  30.74 
 
 		 252 aa  92  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  27.08 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  25.61 
 
 		 278 aa  91.7  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0841  tRNA pseudouridine synthase A  25.1 
 
 		 305 aa  91.7  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>