More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0747 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0747  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 258 aa  536  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1426  tRNA pseudouridine synthase A  52.9 
 
 		 241 aa  252  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000043766  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0699  tRNA pseudouridine synthase A  50.97 
 
 		 243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148099  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0973  tRNA pseudouridine synthase A  46.42 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.607139  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0914  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.992712  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1186  tRNA pseudouridine synthase A  43.63 
 
 		 241 aa  208  6e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0288675  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0844  tRNA pseudouridine synthase A  42.25 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0975  tRNA pseudouridine synthase A  44.62 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.892125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1128  tRNA pseudouridine synthase A  33.72 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0994  pseudouridylate synthase  37.21 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  33.21 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.11 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  29.92 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.95 
 
 		 245 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  30.15 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.2 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  31.18 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  31.56 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  31.18 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  30.65 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.79 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  32.3 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  31.91 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  28.79 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16531  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0673067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1318  tRNA pseudouridine synthase A  28.74 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620089  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.7 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2585  tRNA pseudouridine synthase A  29.12 
 
 		 275 aa  105  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  31.27 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  30.47 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  27.99 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.45 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  31.13 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  31.52 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  29.66 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  31.52 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  29.59 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  30.74 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  28.52 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  28.52 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  28.14 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  30.57 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  30.57 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1018  pseudouridylate synthase  30.83 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  28.2 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  31.13 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  28.74 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  28.14 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  30.35 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  32.08 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1368  tRNA pseudouridine synthase A  27.72 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0012  tRNA pseudouridine synthase A  32.45 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl155  tRNA pseudouridine synthase A  29.93 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  30.74 
 
 		 245 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0389  tRNA pseudouridine synthase A  28.95 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  29.66 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1420  tRNA pseudouridine synthase A  28.89 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  27.72 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  28.73 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  28.96 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  30.74 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2207  tRNA pseudouridine synthase A  30.42 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  28.57 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0717  tRNA pseudouridine synthase A  27.97 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000371927  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1529  tRNA pseudouridine synthase A  28.52 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0361  tRNA pseudouridine synthase A  28.52 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  29.57 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1123  tRNA pseudouridine synthase A  29.17 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0266785  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1700  tRNA pseudouridine synthase A  30 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.125972 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  30.68 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  28.9 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2714  tRNA pseudouridine synthase ACD  35 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.971768  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  31.39 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  31.39 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  30.68 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0217  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.73 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  28.62 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  27.34 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  29.96 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02243  tRNA pseudouridine synthase A  29.01 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1338  tRNA pseudouridine synthase A  29.01 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02203  hypothetical protein  29.01 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2800  tRNA pseudouridine synthase A  29.2 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  27.82 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2598  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.814522  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1334  tRNA pseudouridine synthase A  29.01 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0627  tRNA pseudouridine synthase A  30.37 
 
 		 241 aa  98.6  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3729  tRNA pseudouridine synthase A  28.36 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  27.82 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2610  tRNA pseudouridine synthase A  29.77 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2469  tRNA pseudouridine synthase A  29.01 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  25.94 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  29.32 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  29.32 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  27.82 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  27.44 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  27.82 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>