More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0717 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0717  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 282 aa  587  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000371927  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2585  tRNA pseudouridine synthase A  80.66 
 
 		 275 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3729  tRNA pseudouridine synthase A  69.82 
 
 		 306 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  69.63 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  69.63 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1318  tRNA pseudouridine synthase A  67.16 
 
 		 282 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620089  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2986  tRNA pseudouridine synthase A  66.79 
 
 		 272 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2207  tRNA pseudouridine synthase A  60.51 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23281  tRNA pseudouridine synthase A  52.77 
 
 		 295 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0351  tRNA pseudouridine synthase A  51.29 
 
 		 293 aa  278  5e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.89141 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16531  tRNA pseudouridine synthase A  48.88 
 
 		 289 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0673067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19791  tRNA pseudouridine synthase A  50.57 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1104  tRNA pseudouridine synthase A  50.57 
 
 		 276 aa  262  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.723318  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1980  tRNA pseudouridine synthase A  49.63 
 
 		 300 aa  247  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0478647  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  44.49 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17411  tRNA pseudouridine synthase A  44.11 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17151  tRNA pseudouridine synthase A  45.63 
 
 		 268 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.137278  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17251  tRNA pseudouridine synthase A  42.97 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  39.75 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02243  tRNA pseudouridine synthase A  36.58 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1334  tRNA pseudouridine synthase A  36.58 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02203  hypothetical protein  36.58 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2469  tRNA pseudouridine synthase A  36.58 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  39.27 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1338  tRNA pseudouridine synthase A  36.19 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556339  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  39.67 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  36.19 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2612  tRNA pseudouridine synthase A  36.19 
 
 		 270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  36.19 
 
 		 270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2598  tRNA pseudouridine synthase A  35.16 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.814522  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  35.16 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2610  tRNA pseudouridine synthase A  35.16 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  34.82 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  35.16 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  35.16 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  37.3 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  35.66 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  37.3 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  40.24 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  36.36 
 
 		 261 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  36.29 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  38.87 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  38.37 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  36.74 
 
 		 261 aa  168  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  36.99 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  39.27 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  38.62 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  36.95 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2111  tRNA pseudouridine synthase A  43.6 
 
 		 254 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.110217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  38.31 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1265  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  36.51 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  36.99 
 
 		 263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1266  tRNA pseudouridine synthase A  36.33 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  35.97 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  35.23 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  39.09 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  36.78 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  35.95 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  36.18 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  35.68 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  33.71 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  35.32 
 
 		 273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  33.71 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  33.71 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  34.85 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  36.1 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  34.47 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  35.43 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  35.68 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  33.6 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0361  tRNA pseudouridine synthase A  34.78 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  35.8 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1529  tRNA pseudouridine synthase A  34.78 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1420  tRNA pseudouridine synthase A  34.78 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  35.68 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1916  tRNA pseudouridine synthase A  37.14 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.392139  normal  0.974239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2251  tRNA pseudouridine synthase A  40.71 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  38.21 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1969  tRNA pseudouridine synthase A  36.22 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1408  tRNA pseudouridine synthase A  34.33 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  36.82 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1337  tRNA pseudouridine synthase A  36.99 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.354676  normal  0.497364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  36.07 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>