More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1426 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1426  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000043766  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0699  tRNA pseudouridine synthase A  68.88 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.148099  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0975  tRNA pseudouridine synthase A  55 
 
 		 244 aa  261  8.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.892125  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1186  tRNA pseudouridine synthase A  52.08 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0288675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0914  tRNA pseudouridine synthase A  51.67 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.992712  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0747  tRNA pseudouridine synthase A  52.9 
 
 		 258 aa  252  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0844  tRNA pseudouridine synthase A  51.25 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0973  tRNA pseudouridine synthase A  46.01 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.607139  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0994  pseudouridylate synthase  41.08 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1128  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  32.66 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3334  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000208005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  33.47 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  31.15 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  33.06 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3828  tRNA pseudouridine synthase A  31.15 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  32.53 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1444  tRNA pseudouridine synthase A  31.97 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  30.52 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.24 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  33.61 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0491  tRNA pseudouridine synthase A  29.71 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1859  tRNA pseudouridine synthase ACD  32.77 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.08 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  30.99 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl155  tRNA pseudouridine synthase A  31.08 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0686  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.74 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000903127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1416  tRNA pseudouridine synthase A  34.68 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1013  tRNA pseudouridine synthase A  32.65 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00481076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  32.51 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  29.67 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  30.74 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  32.93 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  31.17 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2867  tRNA pseudouridine synthase A  32.1 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.42429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3695  tRNA pseudouridine synthase A  33.2 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  32.93 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.2 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  29.1 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  30.92 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  32.68 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  32.13 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1355  tRNA pseudouridine synthase A  30.29 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0794079  normal  0.0223344 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3458  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2139  tRNA pseudouridine synthase A  28.4 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.357252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2474  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2696  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  30.4 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1395  tRNA pseudouridine synthase A  29.92 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1338  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.556339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2612  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1337  tRNA pseudouridine synthase A  32.66 
 
 		 269 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.354676  normal  0.497364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0675  tRNA pseudouridine synthase A  34.31 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02243  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  30.42 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02203  hypothetical protein  31.69 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1334  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.673735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  29.84 
 
 		 244 aa  98.6  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2469  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2610  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.422355  normal  0.0539335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2510  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2556  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2719  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.152064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  33.33 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  30 
 
 		 260 aa  98.6  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2598  tRNA pseudouridine synthase A  31.69 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.814522  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 247 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 247 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 247 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 247 aa  98.6  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 252 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  30 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0868  tRNA pseudouridine synthase A  32.87 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00469579  hitchhiker  0.00315924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  30 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1258  tRNA pseudouridine synthase A  29.64 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2576  tRNA pseudouridine synthase A  31.71 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  30 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  30.36 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  30.89 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  30.08 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1523  tRNA pseudouridine synthase A  31.47 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000575068  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3066  tRNA pseudouridine synthase A  31.15 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301608  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  30.08 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0079  tRNA pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.594696  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  28.69 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0447  tRNA pseudouridine synthase A  30.8 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.801238 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  29.58 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  28.8 
 
 		 267 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  28.99 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  28.8 
 
 		 267 aa  96.3  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4667  tRNA pseudouridine synthase A  29.67 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  32.26 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  30 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  30.08 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  32.26 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1368  tRNA pseudouridine synthase A  29.72 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7335  tRNA pseudouridine synthase A  32.35 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>