More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1669 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  774    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  70.13 
 
 
385 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  70.13 
 
 
385 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  70.13 
 
 
385 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  61.66 
 
 
387 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  50.79 
 
 
380 aa  418  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  26.39 
 
 
748 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  27.71 
 
 
778 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  25.81 
 
 
755 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25.96 
 
 
758 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  29.04 
 
 
764 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25.87 
 
 
812 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  28.1 
 
 
752 aa  130  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  30.74 
 
 
874 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  27.53 
 
 
1359 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26.3 
 
 
756 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  33.48 
 
 
832 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  25 
 
 
752 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  28.18 
 
 
747 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  30.17 
 
 
855 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  24.23 
 
 
777 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.74 
 
 
746 aa  116  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  26.25 
 
 
777 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.34 
 
 
905 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  27.07 
 
 
862 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  33.97 
 
 
895 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  22.49 
 
 
861 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  35.29 
 
 
845 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  26.91 
 
 
1204 aa  96.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  32.42 
 
 
1011 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  30.27 
 
 
1131 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  35.25 
 
 
923 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  26.59 
 
 
821 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  32.79 
 
 
872 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  31.12 
 
 
849 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  36.15 
 
 
1109 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  27.86 
 
 
862 aa  90.5  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  25.49 
 
 
864 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  35.21 
 
 
899 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  31.87 
 
 
859 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  22.04 
 
 
803 aa  87  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  27.33 
 
 
889 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  26.73 
 
 
898 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  31.95 
 
 
920 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  25.25 
 
 
805 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  32.19 
 
 
839 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  33.1 
 
 
1128 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.54 
 
 
883 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  24.55 
 
 
784 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.95 
 
 
883 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  21.13 
 
 
921 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  31.49 
 
 
893 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  22.99 
 
 
821 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  24.34 
 
 
709 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  24.65 
 
 
685 aa  80.1  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  25.42 
 
 
972 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  23.28 
 
 
1028 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  22.65 
 
 
687 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  26.2 
 
 
820 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  31.03 
 
 
1022 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  31.03 
 
 
1022 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  32.86 
 
 
1040 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  25.9 
 
 
797 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  32.14 
 
 
681 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  25.41 
 
 
843 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  29.3 
 
 
967 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.68 
 
 
1045 aa  76.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  25.5 
 
 
786 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.57 
 
 
807 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.28 
 
 
808 aa  76.3  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  24.23 
 
 
835 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  30.43 
 
 
842 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  33.09 
 
 
879 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.14 
 
 
837 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  23.36 
 
 
796 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  23.83 
 
 
684 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  25.89 
 
 
869 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.78 
 
 
773 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  25.89 
 
 
869 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  34.01 
 
 
795 aa  74.7  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  28.2 
 
 
695 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  22.53 
 
 
787 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  24.52 
 
 
763 aa  73.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.45 
 
 
800 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  23.53 
 
 
791 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  22.69 
 
 
796 aa  73.6  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  26.57 
 
 
786 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.43 
 
 
815 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.43 
 
 
755 aa  72.8  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  23.65 
 
 
945 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  23.65 
 
 
945 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  23 
 
 
796 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  31.39 
 
 
767 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  26.7 
 
 
784 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  22.94 
 
 
1109 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  31.76 
 
 
792 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  30.71 
 
 
1003 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.35 
 
 
778 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  30.52 
 
 
1013 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  32.05 
 
 
810 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>