More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0541 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  53.78 
 
 		 1078 aa  1146    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  55.73 
 
 		 1075 aa  1208    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  51.65 
 
 		 1075 aa  1114    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  51.15 
 
 		 1074 aa  1119    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  41.42 
 
 		 1064 aa  808    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  50.28 
 
 		 1077 aa  1087    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  46.88 
 
 		 1089 aa  989    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  41.93 
 
 		 1069 aa  824    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  38.5 
 
 		 1053 aa  701    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  55.72 
 
 		 1075 aa  1228    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  44.55 
 
 		 1067 aa  929    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  46.94 
 
 		 1081 aa  964    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  53.82 
 
 		 1082 aa  1216    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  42.48 
 
 		 1071 aa  838    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  42.66 
 
 		 1065 aa  840    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  100 
 
 		 1090 aa  2254    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.96 
 
 		 1085 aa  962    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  42.84 
 
 		 1077 aa  848    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  46.53 
 
 		 1083 aa  999    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  44.13 
 
 		 1072 aa  877    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  42.57 
 
 		 1077 aa  832    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  42.1 
 
 		 1112 aa  811    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  66.3 
 
 		 1087 aa  1545    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  36.95 
 
 		 1065 aa  651    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  42.38 
 
 		 1078 aa  850    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  67.48 
 
 		 696 aa  971    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.01 
 
 		 1016 aa  227  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  29.14 
 
 		 1131 aa  216  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  25.65 
 
 		 1124 aa  204  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  27.37 
 
 		 1128 aa  191  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  27.31 
 
 		 1153 aa  189  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  28.01 
 
 		 1109 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  27.28 
 
 		 1100 aa  168  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  24.72 
 
 		 1143 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  25.77 
 
 		 853 aa  164  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  24.02 
 
 		 1052 aa  162  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  24.42 
 
 		 1086 aa  160  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  27.4 
 
 		 1080 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  24.02 
 
 		 1051 aa  157  8e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  27.06 
 
 		 1086 aa  157  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  26.32 
 
 		 1099 aa  149  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  23.74 
 
 		 1127 aa  144  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  24.62 
 
 		 1065 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  25.03 
 
 		 1122 aa  139  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.58 
 
 		 1109 aa  138  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  25 
 
 		 1160 aa  135  3.9999999999999996e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  22.78 
 
 		 1086 aa  134  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  25.85 
 
 		 1125 aa  117  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  22.81 
 
 		 1117 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  27.25 
 
 		 1153 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  30.83 
 
 		 1140 aa  111  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  23.51 
 
 		 1060 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  23.66 
 
 		 1172 aa  90.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  36.08 
 
 		 1147 aa  88.2  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  22.67 
 
 		 952 aa  84.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1144 aa  84.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.46 
 
 		 835 aa  84  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  26.78 
 
 		 1187 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  36.77 
 
 		 1037 aa  82  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  26.8 
 
 		 941 aa  79.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  30.46 
 
 		 1065 aa  79.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  30.46 
 
 		 1065 aa  79.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  29.78 
 
 		 948 aa  78.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  22.88 
 
 		 1082 aa  78.2  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  29.92 
 
 		 1138 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.48 
 
 		 966 aa  77.4  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  30.27 
 
 		 584 aa  76.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.37 
 
 		 877 aa  77  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  28.44 
 
 		 945 aa  76.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  29.95 
 
 		 1013 aa  76.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  30.82 
 
 		 946 aa  75.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  22.82 
 
 		 1177 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  32.39 
 
 		 910 aa  75.5  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  28.48 
 
 		 1043 aa  75.5  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 1046 aa  75.1  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.68 
 
 		 933 aa  74.7  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  35.06 
 
 		 933 aa  74.7  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  31.79 
 
 		 669 aa  74.3  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  31.55 
 
 		 919 aa  73.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  32.39 
 
 		 969 aa  73.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  30.86 
 
 		 972 aa  73.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  27.63 
 
 		 964 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  26.69 
 
 		 962 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  28.46 
 
 		 840 aa  72.4  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  31.65 
 
 		 950 aa  71.6  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  31.47 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  23.36 
 
 		 1165 aa  71.2  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  26.26 
 
 		 940 aa  71.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 1116 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  26.32 
 
 		 541 aa  71.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  31.33 
 
 		 986 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  23.05 
 
 		 915 aa  70.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.11 
 
 		 584 aa  70.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  30.53 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  25.75 
 
 		 1170 aa  69.7  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 968 aa  69.7  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.85 
 
 		 949 aa  69.3  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  35.29 
 
 		 1169 aa  69.3  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  28.73 
 
 		 1160 aa  68.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.35 
 
 		 1145 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>