More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0101 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  100 
 
 		 273 aa  530  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  29.07 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  30.64 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  27.43 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  30.42 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  27.9 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  25.34 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  33.9 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  28.32 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  25.61 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  31.93 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  32.12 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  35.39 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  29.64 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  29.44 
 
 		 570 aa  79.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  28.66 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  32.28 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  31.1 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  32.02 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.77 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  27.6 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  30.58 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.42 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  30.77 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  34.31 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  32.31 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  27.11 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  28.49 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.53 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  29.67 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  28.67 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.99 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  30.62 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  24.4 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 128 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  33.18 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  33.5 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  30 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  29.24 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  30 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  28.18 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  29.24 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  24.13 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  27.67 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  27.67 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  27.67 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  26.16 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28.52 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1702  UspA domain protein  26.22 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.38 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  29.18 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  30.18 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  23.57 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.16 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  26.72 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  27.81 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  28.78 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.68 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  29.79 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.47 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.7 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  26.71 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  29.67 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  31.65 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  27.5 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.73 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  26.69 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  26.14 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  27 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  31.76 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  32.12 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  31.35 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.81 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  26.4 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  32.94 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  29.19 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  26.5 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.86 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  32.93 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.49 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>