More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1809 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1809  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 868 aa  1780    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.37 
 
 		 1253 aa  347  4e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 1669 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 1050 aa  210  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  32.87 
 
 		 844 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.49 
 
 		 774 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 933 aa  193  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 1273 aa  181  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 		 845 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 		 845 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 1267 aa  173  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.55 
 
 		 712 aa  171  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 554 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  47.31 
 
 		 315 aa  164  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  47.71 
 
 		 306 aa  160  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  29.53 
 
 		 1248 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 945 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 1267 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 1227 aa  150  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 891 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 608 aa  144  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 		 1977 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  46.72 
 
 		 1845 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 		 971 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1453  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  50.85 
 
 		 491 aa  131  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 865 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1309 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 1255 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 481 aa  124  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  42.18 
 
 		 1833 aa  122  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 1325 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.8 
 
 		 1330 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  43.07 
 
 		 1809 aa  119  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 		 1297 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 851 aa  119  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 914 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 		 1548 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  40.29 
 
 		 1837 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 		 1391 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 1040 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.23 
 
 		 1328 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  42.67 
 
 		 1836 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1078 aa  108  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  40.24 
 
 		 1324 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 835 aa  106  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 813 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 1039 aa  105  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3372  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.01 
 
 		 659 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0581  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.01 
 
 		 659 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  34.38 
 
 		 692 aa  103  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 1205 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 934 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 		 1407 aa  102  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 		 1088 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1287 aa  101  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3543  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.3 
 
 		 659 aa  100  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 		 1419 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2725  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 834 aa  100  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0569323  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  47 
 
 		 1124 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.81 
 
 		 1643 aa  100  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2688  putative PAS/PAC sensor protein  37.76 
 
 		 937 aa  99.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.139133 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 769 aa  98.6  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 768 aa  97.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  26.9 
 
 		 1015 aa  96.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0693  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.17 
 
 		 664 aa  95.9  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  29.4 
 
 		 1113 aa  95.5  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.46 
 
 		 664 aa  95.1  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  23.87 
 
 		 1379 aa  95.1  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 809 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3694  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.46 
 
 		 664 aa  94.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.46 
 
 		 664 aa  94.7  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 1645 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 663 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 1301 aa  92  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  22.48 
 
 		 1079 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 839 aa  92  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 849 aa  91.7  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 		 1177 aa  91.7  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.08 
 
 		 1559 aa  91.3  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 789 aa  91.3  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  26.84 
 
 		 1037 aa  90.9  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 862 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  24.02 
 
 		 1092 aa  89.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 984 aa  89  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  25.48 
 
 		 906 aa  89  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.86 
 
 		 1331 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 1246 aa  88.6  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 1329 aa  88.6  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 3706 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1799  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 1150 aa  87  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 873 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 1253 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 1359 aa  87  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 1185 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2138  putative PAS/PAC sensor protein  42.61 
 
 		 849 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.906633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9041  two component sensor kinase/response regulator hybrid  40.37 
 
 		 701 aa  87  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  21.91 
 
 		 1061 aa  85.1  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 1399 aa  85.1  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  26.47 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>