100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2301 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2301  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1212  LuxR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 251 aa  195  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1550  putative regulatory protein  42.49 
 
 		 260 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3724  response regulator receiver protein  33.2 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.954342  normal  0.199959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0175  LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.508003  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  22.11 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  23 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.51 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  27.07 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.07 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.07 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  27.52 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  23.21 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  25.89 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2247  LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.788747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0350  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6196  transcriptional regulator, LuxR family  24.26 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4639  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84039  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  25.33 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  21.21 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  22.98 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3193  LuxR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.800778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  28.24 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  21.9 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 316 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  21.61 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  21.61 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  21.61 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 339 aa  45.4  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  25.93 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5012  regulatory protein, LuxR  22.36 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.136049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  31.87 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2311  LuxR family transcriptional regulator  27 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4904  DNA-binding transcriptional activator BglJ  37.1 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.53459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4956  DNA-binding transcriptional activator BglJ  37.1 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3418  response regulator receiver protein  27.51 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4801  DNA-binding transcriptional activator BglJ  37.1 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.564373  normal  0.609809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4869  DNA-binding transcriptional activator BglJ  37.1 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0232651  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4962  DNA-binding transcriptional activator BglJ  37.1 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.793457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  25.93 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  35.24 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3684  LuxR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  21.24 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6376  transcriptional regulator, LuxR family  24.62 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.888984 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2525  LuxR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.853805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  25.57 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0514  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  23.58 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0116  LuxR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 105 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  45 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4509  autoinducer-binding domain-containing protein  22.51 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  25.68 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  24.02 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5017  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 326 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4641  LuxR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1757  response regulator receiver protein  26.37 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.94 
 
 		 302 aa  42.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6096  LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1151  two-component response regulator  43.33 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 		 207 aa  42.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 204 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1991  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.51 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141856  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2699  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 216 aa  42.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 243 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 305 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4147  transcriptional regulator, LuxR family  18.58 
 
 		 242 aa  42  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 215 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2976  LuxR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 255 aa  42  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.575225 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 210 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 799 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 210 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 306 aa  42  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 217 aa  42  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.68 
 
 		 850 aa  42  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>