More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4639 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4639  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84039  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 234 aa  172  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3239  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 274 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5451  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1122  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.75 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.752968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3668  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2713  two component LuxR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  41.04 
 
 		 225 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  40.46 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  37.06 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  33.67 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  35.94 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  33.33 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1716  two component LuxR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  31.66 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 218 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  34.33 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  33.5 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 214 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  38.38 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  33.16 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3829  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.026767 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  31 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  30.46 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  32.46 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  32.46 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2387  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.28 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.132486  normal  0.384012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.79 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  34.8 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  32.47 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.84 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  35.92 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.26 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  32.99 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.5 
 
 		 239 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  37.7 
 
 		 218 aa  101  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.84 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 230 aa  101  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.49 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.2 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.15 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>