More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3193 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3193  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  497  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.800778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1935  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0226826  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0797  transcriptional regulator, LuxR family  24.56 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0175  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.508003  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  30.98 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  28.64 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  35.56 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  28.37 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  25.96 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  25.96 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3342  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.64 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.64 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.64 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2210  LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  27.36 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  26.36 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.21 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  25.21 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.36 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  26.4 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  29.02 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1715  LuxR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  hitchhiker  0.000116776 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  21.39 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1547  LuxR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1655  LuxR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  24.87 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0243  regulatory protein LuxR  31.65 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  24 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  36.79 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4066  transcriptional regulator LuxR family  35.87 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7112  LuxR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0985225  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  28.36 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  24.1 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  28 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  41.49 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  23.98 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  37.65 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1293  DNA-binding transcriptional activator SdiA  37.65 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  hitchhiker  0.0000202879 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2112  DNA-binding transcriptional activator SdiA  37.65 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.722664  hitchhiker  0.0000000000000595752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2165  DNA-binding transcriptional activator SdiA  37.65 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0921825  hitchhiker  0.00000020452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  24 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1170  DNA-binding transcriptional activator SdiA  37.65 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0141324  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  26.29 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5675  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5466  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.21524 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  25.59 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.59 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.59 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2247  LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.788747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2507  LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 592 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  24.61 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 595 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  47.37 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5387  autoinducer-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 320 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.841269  normal  0.0379322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  19.23 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  41.67 
 
 		 595 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  19.23 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  41.67 
 
 		 595 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  41.54 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2976  LuxR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.575225 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5224  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 74 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.8 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  27.48 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>