More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5466 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5675  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5466  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.21524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4374  transcriptional regulator LuxR family  39.24 
 
 		 246 aa  61.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3140  regulatory protein LuxR  31.62 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  23.53 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4554  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376132  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.42 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1652  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  22.02 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.02 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  20.83 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  20.83 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.9 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.9 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  20.93 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2668  two component LuxR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  19.81 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  38.71 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  22.46 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0149  DNA-binding response regulator  24.51 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3193  LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.800778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 302 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0757  LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3102  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.27 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.774177  normal  0.15342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 249 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 246 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1157  two component LuxR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19740  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.33 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.93 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  37.7 
 
 		 947 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  23.23 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.28 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1989  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  24.88 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  22.75 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  36.07 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1558  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.1 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  22.68 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0094  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.88 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2886  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197544  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.7 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.34 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  21.16 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.49 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  22.75 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  23.83 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.93 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  36.07 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  22 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1053  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.0294181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.19 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05591  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  23.16 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 		 877 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2409  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  19.07 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>