More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5224 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5224  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 74 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.46 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  50.88 
 
 		 254 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 239 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 239 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 239 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 239 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.46 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.46 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.46 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.46 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 200 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 211 aa  53.9  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.46 
 
 		 394 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 210 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  45.9 
 
 		 200 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 200 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  45.9 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  45.9 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.9 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  45.9 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  45.9 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  45.9 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  45.9 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  45.9 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 269 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.46 
 
 		 425 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  49.09 
 
 		 286 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0702  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 245 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 208 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 209 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 215 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 239 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 339 aa  50.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3420  LuxR family DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3193  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 243 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.800778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  44.62 
 
 		 286 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 967 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4539  transcriptional regulator, LuxR family, autoinducer-regulated  49.12 
 
 		 254 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 254 aa  50.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 244 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 206 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 506 aa  50.1  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 232 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  48.08 
 
 		 904 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 209 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  42.37 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 309 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2603  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0876088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3548  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 924 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 297 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 781 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41810  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 		 901 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 262 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.62 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0536  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 244 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3118  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 391 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 292 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 211 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.76 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5514  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 213 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  34.43 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 308 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.94 
 
 		 223 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 982 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>