213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3342 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3342  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3193  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.800778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  27.05 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3102  LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 239 aa  53.1  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.644499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  27.12 
 
 		 254 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.63 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 506 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  38.67 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1575  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0348  putative GAF sensor protein  43.1 
 
 		 341 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  31.78 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0350  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2247  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.788747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.73 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2658  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0670  regulatory protein LuxR  43.08 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.77 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  32.89 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  27.61 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3070  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000689776  unclonable  0.00000000000283062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1241  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000399601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1319  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0542522  decreased coverage  0.000972679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  44.83 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2757  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0593961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1285  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000337392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0966  transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 134 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1240  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 233 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2088  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 135 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 302 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 427 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12791  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0492582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.35 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  35.62 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2824  transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 550 aa  45.8  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  46.15 
 
 		 944 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35 
 
 		 512 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3726  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 826 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.473578  normal  0.0380673 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4133  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  45.45 
 
 		 916 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2146  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.208263  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  40 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1820  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.0923177 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5224  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 74 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  26.87 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  40 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.82 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0377  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1766  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  30.22 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1935  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0226826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.99 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0231149  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3205  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 74 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5893  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4238  germination protein  38.6 
 
 		 74 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4724  germination protein GerE  38.6 
 
 		 74 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105908  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.69 
 
 		 862 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>