More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3726 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3726  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 826 aa  1576    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.473578  normal  0.0380673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  44.76 
 
 		 937 aa  62.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4862  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.27 
 
 		 215 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0555  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.3 
 
 		 227 aa  59.3  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4345  regulatory protein LuxR  32.57 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4714  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 216 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.375128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1154  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 386 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 221 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 222 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 209 aa  55.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4339  response regulator receiver protein  50 
 
 		 233 aa  55.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2267  putative adenylate/guanylate cyclase  29.56 
 
 		 703 aa  55.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 221 aa  54.7  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  38 
 
 		 248 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 235 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 217 aa  54.3  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 216 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  43.42 
 
 		 222 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 231 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 216 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 914 aa  53.5  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 227 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  44.29 
 
 		 219 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  44.29 
 
 		 219 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 216 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0800  transcriptional regulator, LuxR family protein  45.76 
 
 		 130 aa  53.5  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 973 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 208 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 216 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 226 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  47.37 
 
 		 223 aa  52.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 212 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 211 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 916 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 220 aa  52.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  38.04 
 
 		 943 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0243  regulatory protein LuxR  40.91 
 
 		 245 aa  52.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 208 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  43.55 
 
 		 919 aa  52  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 225 aa  51.6  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 230 aa  52  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 230 aa  52  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 239 aa  52  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.52 
 
 		 1422 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 212 aa  51.6  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.21 
 
 		 230 aa  52  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  48.21 
 
 		 230 aa  52  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  48.21 
 
 		 230 aa  52  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  48.21 
 
 		 230 aa  52  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 246 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 230 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 230 aa  51.6  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0306  transcriptional regulator, LuxR family  39.74 
 
 		 248 aa  51.6  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  41.86 
 
 		 937 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 202 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  38.81 
 
 		 216 aa  51.6  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1067  transcriptional regulator, LuxR family  39.78 
 
 		 205 aa  51.2  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.506731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 249 aa  51.2  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 506 aa  51.6  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 213 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 208 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 209 aa  51.2  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03368  predicted DNA-binding response regulator in two-component regulatory system  42.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000358261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0193  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000210245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4008  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 215 aa  51.2  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.73 
 
 		 222 aa  51.2  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03321  hypothetical protein  42.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00023179  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3723  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4883  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0197  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000437068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 209 aa  51.2  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3824  LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201276 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3925  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.237516  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 231 aa  51.2  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 209 aa  51.2  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 552 aa  50.8  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 206 aa  51.2  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 215 aa  51.2  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  41.27 
 
 		 217 aa  51.2  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 213 aa  50.8  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  43.33 
 
 		 879 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  34.55 
 
 		 215 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 508 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 229 aa  50.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  44.07 
 
 		 218 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.82 
 
 		 894 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 209 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 209 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  50.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0084  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 267 aa  50.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0338  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 248 aa  50.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  40 
 
 		 222 aa  50.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 952 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  30.67 
 
 		 900 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 981 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1738  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 267 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3116  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 215 aa  50.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>