More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0306 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0306  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0338  transcriptional regulator, LuxR family  95.97 
 
 		 248 aa  493  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.137643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4066  transcriptional regulator LuxR family  66.36 
 
 		 248 aa  297  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0243  regulatory protein LuxR  63.06 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2601  regulatory protein LuxR  29.36 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0918  transcriptional regulator LuxR family  52.46 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0287  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0505  transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0318  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0548  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1559  regulatory protein LuxR  41.49 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  42.62 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3273  transcriptional regulator LuxR family  38.89 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0440  regulatory protein LuxR  34.62 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0539143 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2957  transcriptional regulator protein  36.56 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.923766  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.06 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1890  transcriptional regulator LuxR family  39.33 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0351  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637296  normal  0.0151595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2818  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0185947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1702  regulatory protein, LuxR  42.19 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139777  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  36.17 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  39.71 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3087  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0175  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.508003  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  38.36 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3310  regulatory protein, LuxR  42.25 
 
 		 512 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 333 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  39.06 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  39.06 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  36.17 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 339 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  43.55 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  43.55 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  32.05 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 306 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  43.55 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1549  LuxR transcriptional regulator  41.54 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.152747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  31.47 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  40.85 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4359  regulatory protein, LuxR  38.27 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  39.06 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.55 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  39.06 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3402  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.511462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  39.06 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  40 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1132  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.42 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3665  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4509  autoinducer-binding domain-containing protein  43.86 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  39.06 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>