More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3418 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3684  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3418  response regulator receiver protein  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3149  aldose 1-epimerase  82.76 
 
 		 207 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.491093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1708  response regulator receiver protein  51.21 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1757  response regulator receiver protein  50.72 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6096  LuxR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7381  DNA-binding HTH domain-containing proteins  45.41 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4185  hypothetical protein  44.56 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.382441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0311  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.421668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0786  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.537996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0387  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1741  LuxR family protein  36.89 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0795299  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2508  response regulator receiver protein  37.63 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0619  LuxR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6095  transcriptional activator  29.79 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1756  autoinducer-binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1707  autoinducer-binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.997736  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  28.89 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  50 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  27.17 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  27.17 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.17 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  27.17 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.17 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  27.17 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.17 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.17 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.17 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  44.07 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  44.07 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  27.03 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.17 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  26.7 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  44.12 
 
 		 879 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.16 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  41.38 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  45.9 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  23.89 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  23.89 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  23.89 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8140  transcriptional regulator TraR  26.74 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  23.89 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  43.55 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2493  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 239 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  23.89 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  37.7 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5675  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  43.4 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8300  transcriptional regulator TraR  26.74 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5466  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.21524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  44.23 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  43.1 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3104  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 163 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  43.55 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4131  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>