148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1708 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1708  response regulator receiver protein  100 
 
 		 219 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6096  LuxR family transcriptional regulator  94.06 
 
 		 219 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1757  response regulator receiver protein  94.06 
 
 		 219 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3149  aldose 1-epimerase  53.27 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.491093 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3684  LuxR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3418  response regulator receiver protein  51.21 
 
 		 226 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4185  hypothetical protein  47.09 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.382441 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7381  DNA-binding HTH domain-containing proteins  46.84 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2508  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0311  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.421668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0387  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1741  LuxR family protein  39.23 
 
 		 203 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0795299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0619  LuxR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 203 aa  132  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0786  response regulator receiver protein  36.72 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.537996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6095  transcriptional activator  30.97 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1756  autoinducer-binding domain-containing protein  30.97 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1707  autoinducer-binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.997736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1550  putative regulatory protein  27.78 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1170  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.59 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0141324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2112  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.59 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.722664  hitchhiker  0.0000000000000595752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2165  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.59 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0921825  hitchhiker  0.00000020452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1293  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.59 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  hitchhiker  0.0000202879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.59 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  23.37 
 
 		 240 aa  51.6  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  23.08 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  23.08 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  22.56 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  22.56 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  22.56 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1450  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  22.05 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  22.05 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.68 
 
 		 1021 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  23.76 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  32.84 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0164  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  41.51 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  24.86 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  35.48 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  41.51 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0175  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.508003  normal  0.575618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0091  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  23.98 
 
 		 247 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0219  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.1 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.463895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  21.2 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  20.54 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1864  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  24.73 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4028  two component LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  34.15 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  25.82 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  22.87 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  35.48 
 
 		 913 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2301  LuxR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  22.92 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 		 913 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  26.2 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  41.51 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  34.15 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2068  LuxR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 85 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0760064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.46 
 
 		 922 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  20.55 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  25.41 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>