296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3149 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3149  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.491093 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3684  LuxR family transcriptional regulator  82.76 
 
 		 226 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3418  response regulator receiver protein  82.76 
 
 		 226 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1708  response regulator receiver protein  53.27 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6096  LuxR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1757  response regulator receiver protein  52.76 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7381  DNA-binding HTH domain-containing proteins  46.86 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4185  hypothetical protein  45.08 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.382441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0311  transcriptional regulator  39.79 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.421668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0387  response regulator receiver protein  40.51 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1741  LuxR family protein  40.51 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0795299  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0786  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.537996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2508  response regulator receiver protein  39.49 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0619  LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1707  autoinducer-binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.997736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6095  transcriptional activator  31.91 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1756  autoinducer-binding domain-containing protein  31.91 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.26 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  27.39 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  27.39 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  48.39 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.39 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.39 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.39 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.39 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  27.39 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.39 
 
 		 239 aa  51.6  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.37 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.37 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1730  transcriptional regulator, LuxR family  26.67 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000557622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2150  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.11 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  38.16 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.94 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1044  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.11 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000369866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2690  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.67 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.0383701 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.56 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.56 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1266  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.11 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00315864  hitchhiker  0.00193945 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  39.66 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0866  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  47.27 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4131  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2721  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  42.31 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  41.51 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  27.03 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3599  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.161431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1867  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00198288  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0618082  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1663  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0154836  unclonable  0.0000152825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1732  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0049943  normal  0.183248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2493  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  42.59 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  47.27 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  39.68 
 
 		 913 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2247  two component LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.998494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2554  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.958854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  42.59 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.79 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>