88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0619 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0619  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  415  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0311  transcriptional regulator  61.93 
 
 		 203 aa  257  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.421668 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0786  response regulator receiver protein  58.92 
 
 		 203 aa  243  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.537996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2508  response regulator receiver protein  54.68 
 
 		 203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1741  LuxR family protein  52.22 
 
 		 203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0795299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0387  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 203 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7381  DNA-binding HTH domain-containing proteins  39.9 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1708  response regulator receiver protein  38.29 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1757  response regulator receiver protein  37.71 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6096  LuxR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1756  autoinducer-binding domain-containing protein  36.88 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6095  transcriptional activator  36.88 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3149  aldose 1-epimerase  35.94 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.491093 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3418  response regulator receiver protein  34.9 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3684  LuxR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 226 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1707  autoinducer-binding domain-containing protein  35.86 
 
 		 162 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.997736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4185  hypothetical protein  36.41 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.382441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2028  LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  29.06 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0097  transcriptional regulator, LuxR family  28.9 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  24.47 
 
 		 307 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  27.14 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  27.78 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  27.78 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  24.61 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  26.26 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  26.26 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 239 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  26.04 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5029  transcriptional regulator, LuxR family  25.79 
 
 		 243 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2165  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.26 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0921825  hitchhiker  0.00000020452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1170  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.26 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0141324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2112  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.26 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.722664  hitchhiker  0.0000000000000595752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2667  transcriptional regulator, LuxR family  25.93 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.530563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  22.89 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1293  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.26 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  hitchhiker  0.0000202879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  26.26 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2928  transcriptional regulator, LuxR family  27.37 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 239 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  24.19 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  24.19 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 240 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3102  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.644499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 241 aa  44.7  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5194  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5462  LuxR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5387  autoinducer-binding domain-containing protein  22.28 
 
 		 320 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.841269  normal  0.0379322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  25.13 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  21.86 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  27.57 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0920  LuxR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.81926  normal  0.148698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  25.95 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  21.86 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.59 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  23.24 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3743  transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 286 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29510  ATP-dependent transcriptional regulator  38.24 
 
 		 992 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.611914 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.46 
 
 		 234 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1935  LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 254 aa  42  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0226826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  24.46 
 
 		 234 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 234 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 266 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.46 
 
 		 236 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  23.44 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4641  LuxR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 235 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.226579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2852  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 236 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>