68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7381 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_7381  DNA-binding HTH domain-containing proteins  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4185  hypothetical protein  54.9 
 
 		 206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.382441 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1708  response regulator receiver protein  46.84 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3418  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3684  LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1757  response regulator receiver protein  46.32 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6096  LuxR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3149  aldose 1-epimerase  46.86 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.491093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0311  transcriptional regulator  40.61 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.421668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2508  response regulator receiver protein  38.69 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0619  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0786  response regulator receiver protein  41.49 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.537996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1741  LuxR family protein  36.18 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0795299  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0387  response regulator receiver protein  36.18 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6095  transcriptional activator  36.54 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1756  autoinducer-binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1707  autoinducer-binding domain-containing protein  35.58 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.997736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3321  LuxR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  27.64 
 
 		 254 aa  48.5  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2174  regulatory protein, LuxR  26.23 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2330  transcriptional regulator, LuxR family  26.23 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20021  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 231 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.46 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  36.76 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1550  putative regulatory protein  23.89 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0943  transcriptional regulator, LuxR family  28.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1723  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  24.14 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0416  LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  40.98 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  25 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4977  transcriptional regulator, LuxR family  26.86 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.142556 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1676  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3193  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.800778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0087  two component transcriptional regulator, LuxR  36.11 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.197031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1611  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  0.234442 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  34.33 
 
 		 595 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0670  regulatory protein, LuxR  38.1 
 
 		 890 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 595 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  34.33 
 
 		 595 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1212  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 251 aa  42  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 		 237 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  34.33 
 
 		 592 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4514  autoinducer-binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.92 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 247 aa  41.2  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5781  response regulator receiver protein  27.93 
 
 		 243 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.305702  hitchhiker  0.00700374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>