272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4754 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  63.78 
 
 		 224 aa  247  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  41.92 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  39.89 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 383 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 185 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 194 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 194 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  34.55 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  30.69 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  33.33 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  34.13 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 245 aa  74.7  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0364  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4851  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  32.92 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  31.22 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  48.31 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  28.28 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  36.15 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0333  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  33.71 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  31.74 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  33.54 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>