More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2681 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  48.12 
 
 		 805 aa  726    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  100 
 
 		 879 aa  1715    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  50 
 
 		 842 aa  719    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  42.2 
 
 		 832 aa  565  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  42.49 
 
 		 923 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  32.92 
 
 		 895 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  35.8 
 
 		 1204 aa  350  8e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  36.54 
 
 		 1011 aa  340  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  35.96 
 
 		 1131 aa  339  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  35.17 
 
 		 1109 aa  301  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  31.34 
 
 		 855 aa  295  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  30.37 
 
 		 862 aa  274  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  31.76 
 
 		 862 aa  274  6e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.67 
 
 		 872 aa  265  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  29.35 
 
 		 1359 aa  253  7e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  29.92 
 
 		 874 aa  250  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  27.49 
 
 		 860 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.97 
 
 		 764 aa  158  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  23.29 
 
 		 748 aa  118  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  23.91 
 
 		 872 aa  118  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  20.65 
 
 		 864 aa  110  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25 
 
 		 812 aa  109  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.75 
 
 		 1051 aa  107  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  25 
 
 		 752 aa  102  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  25.09 
 
 		 807 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  22.58 
 
 		 788 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.03 
 
 		 808 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  26.88 
 
 		 835 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  22.02 
 
 		 787 aa  90.9  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.22 
 
 		 747 aa  89.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  22.66 
 
 		 799 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  25.04 
 
 		 820 aa  89  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  23.17 
 
 		 799 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  23.43 
 
 		 799 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  23 
 
 		 799 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  25.12 
 
 		 756 aa  86.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  30.06 
 
 		 825 aa  86.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.7 
 
 		 767 aa  87  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.28 
 
 		 746 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  28.41 
 
 		 859 aa  85.5  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  26.2 
 
 		 380 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  25.32 
 
 		 811 aa  81.6  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.91 
 
 		 755 aa  81.3  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  21.95 
 
 		 800 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.55 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  25.55 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  23.2 
 
 		 790 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  23.46 
 
 		 794 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  20.11 
 
 		 828 aa  77  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  21.15 
 
 		 778 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  28.49 
 
 		 815 aa  76.6  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.62 
 
 		 803 aa  76.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  33.56 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  29.22 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.26 
 
 		 1045 aa  74.7  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  22.87 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  28 
 
 		 898 aa  74.7  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  22.91 
 
 		 796 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  29.75 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  23.45 
 
 		 752 aa  74.3  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  21.32 
 
 		 795 aa  74.3  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.08 
 
 		 831 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  35.66 
 
 		 845 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  23.5 
 
 		 815 aa  73.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.28 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  25.97 
 
 		 905 aa  72.4  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  22.58 
 
 		 796 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20 
 
 		 869 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  31.74 
 
 		 893 aa  72.4  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  22.69 
 
 		 793 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  19.72 
 
 		 772 aa  72  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  27.32 
 
 		 816 aa  72  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  27.95 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  27.11 
 
 		 865 aa  71.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  28.51 
 
 		 813 aa  71.2  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  26.11 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  24.37 
 
 		 830 aa  69.7  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  26.63 
 
 		 861 aa  68.9  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  20.92 
 
 		 821 aa  68.6  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  23.79 
 
 		 808 aa  68.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  25.58 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  21.83 
 
 		 792 aa  67.8  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.65 
 
 		 804 aa  67.4  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  22.06 
 
 		 786 aa  67  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  23.93 
 
 		 788 aa  67  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27841  RND family transporter: Niemann-Pick type C1 disease protein-like protein  22.53 
 
 		 808 aa  65.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938041  normal  0.0539189 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  28.57 
 
 		 777 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  21.68 
 
 		 767 aa  65.9  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.54 
 
 		 807 aa  65.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  20.47 
 
 		 801 aa  65.1  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  23.25 
 
 		 789 aa  64.3  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  26.32 
 
 		 689 aa  64.3  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  26.56 
 
 		 694 aa  63.9  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.51 
 
 		 773 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  26.87 
 
 		 784 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  26.06 
 
 		 840 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  26.87 
 
 		 755 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  20.07 
 
 		 799 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  24.51 
 
 		 889 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  21.72 
 
 		 769 aa  63.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>