44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27841 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009369  OSTLU_27841  RND family transporter: Niemann-Pick type C1 disease protein-like protein  100 
 
 		 808 aa  1657    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938041  normal  0.0539189 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46869  predicted protein  27.1 
 
 		 956 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0965928  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46867  predicted protein  27.65 
 
 		 918 aa  232  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.793152  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02119  conserved hypothetical protein similar to Neimann-Pick sphingolipid transporter (Eurofung)  24.72 
 
 		 1271 aa  214  4.9999999999999996e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02470  vacuolar membrane protein, putative  25 
 
 		 1330 aa  194  7e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80838  predicted protein  21.39 
 
 		 1268 aa  154  4e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217919  normal  0.355381 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.59 
 
 		 1359 aa  81.3  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29977  predicted protein  20.94 
 
 		 1011 aa  74.7  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0323795  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29594  RND family transporter: Patched (Ptc) segmentation polarity protein  22.76 
 
 		 1183 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45835  predicted protein  25.1 
 
 		 1462 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.720628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.24 
 
 		 807 aa  60.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  20.86 
 
 		 777 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  29.2 
 
 		 879 aa  57  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33867  predicted protein  30.3 
 
 		 342 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.17062  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  24.88 
 
 		 805 aa  52.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33000  RND family transporter: Dispatched segment polarity protein (cholesterol release)  34.26 
 
 		 1154 aa  52  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.69508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.95 
 
 		 779 aa  52  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00950  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 		 1444 aa  51.6  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148388  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  29.84 
 
 		 842 aa  50.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1048 aa  50.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86304  predicted protein  28.18 
 
 		 716 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0810  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  20.99 
 
 		 1053 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0578255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01890  Hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  19.76 
 
 		 1046 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  29.2 
 
 		 792 aa  48.5  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  27.74 
 
 		 764 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2696  AcrB/AcrD/AcrF family protein  19.75 
 
 		 1052 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0572  acriflavin resistance protein  21.29 
 
 		 1033 aa  47  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000015454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  20.45 
 
 		 755 aa  47.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  26.2 
 
 		 862 aa  46.6  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1021 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  21.29 
 
 		 1044 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1850  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  19.14 
 
 		 1052 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0763559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28790  acriflavin resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  21.38 
 
 		 1035 aa  45.8  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2895  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  22.08 
 
 		 1059 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  21.88 
 
 		 861 aa  45.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  25.65 
 
 		 895 aa  45.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  23.11 
 
 		 674 aa  45.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.93 
 
 		 967 aa  45.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  27.03 
 
 		 855 aa  44.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1023 aa  44.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  27.4 
 
 		 889 aa  44.3  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3113  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1030 aa  44.3  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3434  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  19.75 
 
 		 1055 aa  44.3  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0847845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  20.3 
 
 		 1044 aa  44.3  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>