33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46867 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46869  predicted protein  63.13 
 
 		 956 aa  1149    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0965928  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46867  predicted protein  100 
 
 		 918 aa  1876    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.793152  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27841  RND family transporter: Niemann-Pick type C1 disease protein-like protein  27.65 
 
 		 808 aa  232  3e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938041  normal  0.0539189 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02119  conserved hypothetical protein similar to Neimann-Pick sphingolipid transporter (Eurofung)  23.77 
 
 		 1271 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45835  predicted protein  23.84 
 
 		 1462 aa  87.8  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.720628  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80838  predicted protein  26.69 
 
 		 1268 aa  87.4  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.217919  normal  0.355381 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02470  vacuolar membrane protein, putative  24.78 
 
 		 1330 aa  83.2  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29594  RND family transporter: Patched (Ptc) segmentation polarity protein  24.19 
 
 		 1183 aa  66.6  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1920  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  26.47 
 
 		 1044 aa  54.7  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0960887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.94 
 
 		 756 aa  51.6  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  25 
 
 		 1058 aa  50.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  23.15 
 
 		 874 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2073  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1102 aa  48.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0420991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.61 
 
 		 837 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0810  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  27.75 
 
 		 1053 aa  47.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0578255 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001386  cation/multidrug efflux pump  31.11 
 
 		 1027 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0322  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1102 aa  46.6  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  24.74 
 
 		 1038 aa  47  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3448  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  27.56 
 
 		 1034 aa  47  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4304  acriflavin resistance protein  22.46 
 
 		 1102 aa  47  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123043  normal  0.121863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26.43 
 
 		 764 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3434  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  29.07 
 
 		 1055 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0847845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  28.3 
 
 		 861 aa  45.8  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1198  RND efflux transporter  19.23 
 
 		 1022 aa  45.4  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0767  acriflavin resistance plasma membrane protein  19.37 
 
 		 1022 aa  45.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.450822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  23.7 
 
 		 879 aa  45.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  25.81 
 
 		 898 aa  45.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  23.5 
 
 		 805 aa  45.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3428  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  30.49 
 
 		 1076 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1394  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1089 aa  44.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.760431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  25.71 
 
 		 1051 aa  44.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  24.66 
 
 		 1034 aa  44.3  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0837  acriflavin resistance protein  24.22 
 
 		 1030 aa  44.3  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>